More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1199 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 757 aa  1550    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.45 
 
 		 757 aa  1068    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.45 
 
 		 757 aa  1068    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.53 
 
 		 785 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.73 
 
 		 779 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.37 
 
 		 779 aa  532  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.37 
 
 		 779 aa  532  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.51 
 
 		 779 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.08 
 
 		 773 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  39.11 
 
 		 779 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.98 
 
 		 779 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  38.98 
 
 		 779 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.19 
 
 		 779 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.25 
 
 		 779 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.38 
 
 		 779 aa  522  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.18 
 
 		 788 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 732 aa  487  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  38.09 
 
 		 736 aa  476  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  38.71 
 
 		 742 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.7 
 
 		 756 aa  399  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.61 
 
 		 885 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.22 
 
 		 827 aa  353  8e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  37.06 
 
 		 655 aa  353  8e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.88 
 
 		 573 aa  346  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.29 
 
 		 570 aa  346  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.63 
 
 		 907 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.76 
 
 		 573 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.16 
 
 		 572 aa  340  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.51 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.23 
 
 		 811 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.59 
 
 		 572 aa  334  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.04 
 
 		 814 aa  333  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 798 aa  331  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.69 
 
 		 584 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.06 
 
 		 574 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.91 
 
 		 568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 578 aa  328  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.25 
 
 		 1102 aa  326  8.000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34 
 
 		 599 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.99 
 
 		 566 aa  324  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 		 568 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.68 
 
 		 1120 aa  321  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  33.87 
 
 		 574 aa  320  7.999999999999999e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 570 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.78 
 
 		 566 aa  317  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.29 
 
 		 566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.72 
 
 		 831 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.87 
 
 		 1122 aa  313  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1886  exonuclease RecJ  32.63 
 
 		 684 aa  313  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.11 
 
 		 592 aa  313  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  34.13 
 
 		 568 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  35.42 
 
 		 566 aa  311  2e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.44 
 
 		 584 aa  310  9e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.7 
 
 		 568 aa  310  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 576 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.39 
 
 		 801 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.67 
 
 		 763 aa  307  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.45 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.8 
 
 		 564 aa  306  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.76 
 
 		 587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.93 
 
 		 857 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.79 
 
 		 654 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.65 
 
 		 955 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.64 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.47 
 
 		 955 aa  302  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.66 
 
 		 574 aa  302  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.68 
 
 		 1134 aa  301  3e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
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NC_013171  Apre_0909  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.75 
 
 		 576 aa  301  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0055  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.26 
 
 		 523 aa  300  6e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.81 
 
 		 583 aa  300  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009707  JJD26997_0030  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.46 
 
 		 523 aa  300  8e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0028  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.06 
 
 		 523 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.85142  n/a   
 
 
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NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.43 
 
 		 883 aa  299  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.09 
 
 		 989 aa  296  8e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 573 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 571 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.58 
 
 		 567 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4190  exonuclease RecJ  33.51 
 
 		 701 aa  294  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  32.58 
 
 		 578 aa  293  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.39 
 
 		 573 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  33.57 
 
 		 932 aa  293  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  32.23 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.81 
 
 		 864 aa  293  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09101  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.39 
 
 		 625 aa  290  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000188211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  31.58 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.01 
 
 		 977 aa  286  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.41 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_14521  Serine/threonine specific protein phosphatase  32.67 
 
 		 632 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.76 
 
 		 568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.79 
 
 		 865 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  30.85 
 
 		 592 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_008819  NATL1_10381  DHH domain-containing protein  34.41 
 
 		 629 aa  283  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112269 
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.93 
 
 		 1035 aa  283  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_007335  PMN2A_0357  exonuclease RecJ  34.59 
 
 		 622 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.5723  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.75 
 
 		 569 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.63 
 
 		 696 aa  281  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
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