More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1192 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 598 aa  669    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 590 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  88.1 
 
 		 588 aa  1066    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 594 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 602 aa  654    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 598 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 593 aa  696    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 588 aa  1211    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 599 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 614 aa  670    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 591 aa  830    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  66.09 
 
 		 591 aa  820    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 591 aa  828    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 583 aa  684    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 590 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 597 aa  693    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 591 aa  829    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 591 aa  827    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 591 aa  826    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 600 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 593 aa  651    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 593 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 591 aa  830    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 597 aa  671    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 599 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 595 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 596 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 597 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 594 aa  643    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 598 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 595 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 590 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 596 aa  708    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 627 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 600 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 591 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 594 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 606 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 596 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 591 aa  829    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 600 aa  730    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 600 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 		 596 aa  670    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 588 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 587 aa  669    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 600 aa  685    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 600 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 599 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 589 aa  829    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 594 aa  653    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 594 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 592 aa  717    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 599 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 585 aa  722    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 592 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 601 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 590 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 600 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  58.48 
 
 		 592 aa  707    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 591 aa  828    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 593 aa  692    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 596 aa  653    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 590 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 600 aa  678    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 600 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 597 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 597 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 602 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 590 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 593 aa  688    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 592 aa  663    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  88.1 
 
 		 588 aa  1066    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 586 aa  700    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 593 aa  680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 590 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 590 aa  656    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 591 aa  684    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 617 aa  657    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 592 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 583 aa  661    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 600 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 594 aa  728    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 613 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 590 aa  689    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 590 aa  806    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 596 aa  653    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 617 aa  648    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 590 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 594 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 600 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 599 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 608 aa  698    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 		 594 aa  820    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 591 aa  827    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 610 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 598 aa  702    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 599 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  53.14 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>