More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1174 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  316  7e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  92.41 
 
 		 158 aa  277  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  92.41 
 
 		 158 aa  277  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  69.81 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  68.55 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 175 aa  208  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 175 aa  207  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  207  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 175 aa  207  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  64.78 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 156 aa  181  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  57.69 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  57.04 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  53.74 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  55.63 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  50.68 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  50.68 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  48.63 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  47.55 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  47.55 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  48.95 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  48.97 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  58.02 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  47.59 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 156 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  43.67 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  44.37 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  46.76 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 203 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  43.15 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>