77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1160 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1160  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1650  hypothetical protein  81.96 
 
 
194 aa  337  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1685  metal-dependent phosphohydrolase  81.96 
 
 
194 aa  337  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2455  metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 
192 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000047472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0996  metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 
192 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4412  hypothetical protein  45.05 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4451  conserved hypothetical protein TIGR00488  44.51 
 
 
189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4464  conserved hypothetical protein TIGR00488  45.05 
 
 
189 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000106842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4557  hypothetical protein  43.96 
 
 
189 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000033542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4077  hypothetical protein  43.96 
 
 
245 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000820217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0786  hypothetical protein TIGR00488  43.41 
 
 
189 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108111  hitchhiker  0.00000158399 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4067  hypothetical protein  43.96 
 
 
189 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02147e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4229  hypothetical protein  43.96 
 
 
189 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000705206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4353  conserved hypothetical protein TIGR00488  43.96 
 
 
189 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00616609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3057  metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 
189 aa  158  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000330579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4182  metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 
189 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00037025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1240  metal dependent phosphohydrolase  41.85 
 
 
189 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2091  HD domain-containing protein  40.57 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0509907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1234  metal dependent phosphohydrolase  41.14 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000446214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2379  HD domain-containing protein  40.57 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.21965  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1402  HD superfamily NAD metabolism hydrolase  38.62 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595747  hitchhiker  1.0312e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1737  HD superfamily NAD metabolism hydrolase  36.87 
 
 
194 aa  125  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1661  hypothetical protein  38.29 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.181137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0232  HD superfamily hydrolase  37.43 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.407072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0534  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.452404  normal  0.466553 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2111  metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
190 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0964689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1251  metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000664219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2559  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00781757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2517  metal dependent phosphohydrolase  41.1 
 
 
193 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000757991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13400  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
189 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.852112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1582  HD superfamily hydrolase  36.16 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000492911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1602  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000171487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1364  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
190 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0772  metal dependent phosphohydrolase  35.87 
 
 
194 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0566  metal dependent phosphohydrolase  35.98 
 
 
191 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2014  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 
195 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0932  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 
190 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0452437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1143  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0712  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0909  HD superfamily NAD metabolism hydrolase  30.9 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0353677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4551  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.815767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1181  metal dependent phosphohydrolase  32.94 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2545  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0290719  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1782  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3308  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 
193 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000253484  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13050  conserved hypothetical protein TIGR00488  32.02 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.942626  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2007  metal dependent phosphohydrolase  31.64 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00233087  hitchhiker  0.00000000000438339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06000  conserved hypothetical protein TIGR00488  33.15 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0573051  hitchhiker  0.0000000000805771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0685  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000109701  normal  0.0222336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0342  metal dependent phosphohydrolase  31.64 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0305391  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3117  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3003  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1747  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  31.67 
 
 
407 aa  79.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4330  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.42032e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf187  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  30.06 
 
 
358 aa  78.2  0.00000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000620739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0228  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000811799  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl373  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  33.58 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000405157  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0894  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  27.88 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252853 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0529  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  30.94 
 
 
367 aa  68.6  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0318554  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0882  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2795  hypothetical protein TIGR00488  37.1 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.57539  hitchhiker  0.00000474293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0133  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19839  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2618  conserved hypothetical protein TIGR00488  37.39 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0735814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2303  HAD superfamily hydrolase  38.26 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.466568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2575  conserved hypothetical protein TIGR00488  38.26 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000155041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2386  hypothetical protein  38.26 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.700545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2562  hypothetical protein  38.26 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.920482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2565  hypothetical protein  35.96 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0212551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0707  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2229  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00246967  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2342  HAD superfamily hydrolase  36.52 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000394388  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0753  metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 
229 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00455309  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3989  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.347479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2527  conserved hypothetical protein TIGR00488  34.21 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0526  putative nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  29.75 
 
 
392 aa  51.6  0.000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.447363  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2074  HD superfamily hydrolase  32.09 
 
 
224 aa  41.6  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.621625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>