More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1149 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  69.34 
 
 
208 aa  277  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  69.34 
 
 
208 aa  277  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
188 aa  175  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
188 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
188 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
188 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
188 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
188 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  48.91 
 
 
188 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  48.37 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  47.03 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  53.74 
 
 
192 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  52.32 
 
 
208 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  54.42 
 
 
198 aa  168  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  52.26 
 
 
213 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  45.66 
 
 
192 aa  140  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40.7 
 
 
213 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  44.2 
 
 
190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  39.51 
 
 
221 aa  121  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  44.67 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.13 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.67 
 
 
189 aa  118  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  38.92 
 
 
178 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  44.29 
 
 
198 aa  118  7.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  42.54 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  41.61 
 
 
204 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  40 
 
 
194 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  39.42 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  42.19 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  36.9 
 
 
195 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  41.33 
 
 
179 aa  112  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 
228 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  39.88 
 
 
175 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.15 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  42.97 
 
 
195 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.67 
 
 
190 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.19 
 
 
248 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.03 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 
230 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  39.71 
 
 
223 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 
230 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  36.75 
 
 
186 aa  108  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.28 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  43.92 
 
 
190 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  38.1 
 
 
176 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 
189 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  32.47 
 
 
204 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
210 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  39.73 
 
 
181 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 
210 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  41.48 
 
 
200 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  38.52 
 
 
191 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.9 
 
 
200 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  36.31 
 
 
187 aa  104  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  38.78 
 
 
180 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  39.29 
 
 
210 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.35 
 
 
210 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.86 
 
 
217 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  33.67 
 
 
239 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 
207 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  37.43 
 
 
179 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  33.01 
 
 
239 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 
207 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  39.26 
 
 
225 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  34.44 
 
 
173 aa  101  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  38 
 
 
226 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  37.18 
 
 
212 aa  101  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  31 
 
 
200 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.27 
 
 
208 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  37.64 
 
 
181 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
199 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.23 
 
 
198 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  37.33 
 
 
222 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  38.97 
 
 
242 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  34.76 
 
 
206 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  36.59 
 
 
222 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  29.8 
 
 
211 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 
206 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  35.1 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  33.72 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  32.54 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  37.74 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.5 
 
 
207 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.76 
 
 
246 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  38.52 
 
 
217 aa  99  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  36.64 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.89 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  34.1 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
188 aa  98.6  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  33.14 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  34.3 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  34.3 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  31.15 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  34.3 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>