21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1140 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1140  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  655    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1631  hypothetical protein  95.74 
 
 
329 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1665  hypothetical protein  95.74 
 
 
329 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2488  hypothetical protein  76.43 
 
 
331 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000914073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1194  hypothetical protein  73.46 
 
 
345 aa  477  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  normal  0.262929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2899  hypothetical protein  75.24 
 
 
333 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1573  hypothetical protein  72.22 
 
 
329 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0858  hypothetical protein  70.82 
 
 
329 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0765  hypothetical protein  72.31 
 
 
329 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2228  hypothetical protein  64.91 
 
 
328 aa  431  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.508663  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1817  hypothetical protein  66.36 
 
 
329 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.172258  normal  0.343692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0327  hypothetical protein  66.77 
 
 
314 aa  418  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.739831  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2845  hypothetical protein  63.5 
 
 
338 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0018  hypothetical protein  66.05 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000671428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2364  hypothetical protein  69.54 
 
 
329 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3230  hypothetical protein  62.9 
 
 
319 aa  391  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283864  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1337  hypothetical protein  63 
 
 
333 aa  378  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1664  hypothetical protein  58.92 
 
 
334 aa  338  8e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0858  hypothetical protein  50.94 
 
 
352 aa  309  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.364297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3788  putative seryl-tRNA synthetase (serine--tRNA ligase) (SerRS)  54.33 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0714  hypothetical protein  54.36 
 
 
349 aa  293  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0285775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>