More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1134 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 299 aa  607  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  94.31 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  94.31 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  63.73 
 
 		 301 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  64.41 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  64.75 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  64.41 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  64.75 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  64.75 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  64.75 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  64.41 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  64.75 
 
 		 301 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  64.41 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  63.73 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  65.2 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  65.88 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  55.78 
 
 		 302 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  59.32 
 
 		 299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  57.97 
 
 		 299 aa  359  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 300 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  55.44 
 
 		 303 aa  346  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 303 aa  344  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  50.52 
 
 		 301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  53.36 
 
 		 303 aa  338  8e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  52.07 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  55.14 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  56.36 
 
 		 301 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  53.79 
 
 		 297 aa  325  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  47.93 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  47.59 
 
 		 296 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  49.31 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  49.33 
 
 		 305 aa  308  8e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 		 299 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  49.67 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.08 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  47.97 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 298 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  46.74 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  46.58 
 
 		 315 aa  291  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  46.13 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  44.19 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  45.97 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  45.95 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  42.37 
 
 		 303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  47.39 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  44.93 
 
 		 315 aa  269  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  45.45 
 
 		 318 aa  268  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  44.83 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  42.96 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 303 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  40.86 
 
 		 314 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  44.18 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  39.47 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  41.56 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  40.96 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  42.11 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 308 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  42.11 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  42.47 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  41.94 
 
 		 319 aa  255  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>