92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1133 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  73.79 
 
 		 248 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  73.79 
 
 		 248 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  30.4 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30.04 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  29.32 
 
 		 248 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  28.92 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  28.51 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  28.51 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  28.51 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  28.57 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  29.39 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  26.41 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.71 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  26.53 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  20.95 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  22.04 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  20.73 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  24.18 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  22.76 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  22.45 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  24.43 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  27.96 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  25.28 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  27.01 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  25.33 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  21.51 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  21.95 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  26.05 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  24.2 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  22.81 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  25.57 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  23.12 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  22.09 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  28.95 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  22.93 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  22.91 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  20.25 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  23.11 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  22.27 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  22.76 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  22.15 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  23.33 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  20.5 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  21.15 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  19.87 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  25.16 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  32.08 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  27.32 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  23.37 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  25.12 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  26.74 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  22.42 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  21.81 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  23.87 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 300 aa  45.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  21.36 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  22.35 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  21.98 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  24.2 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  32.89 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  19.8 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  23.73 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  23.86 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  28.3 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  24 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  23.59 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  18.9 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  21.55 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  22.7 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  22.7 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  22.7 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  24.24 
 
 		 248 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  22.16 
 
 		 244 aa  42  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>