More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1122 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  82.68 
 
 		 261 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  82.68 
 
 		 261 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  50.8 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  52.23 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 		 256 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 		 256 aa  258  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.16 
 
 		 256 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  43.72 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  41.06 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  40.32 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  40.32 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  39.36 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  39.68 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  41.06 
 
 		 247 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.64 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  45.41 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  39.92 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  39.91 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.8 
 
 		 243 aa  178  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  37.3 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.55 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  40.81 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  39.34 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  36.13 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  38.65 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  40.08 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  36.69 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1634  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  36.51 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  35.74 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  40.32 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  35.74 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  39.08 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  37.94 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1010  ABC transporter related  38.68 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.71 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  37.5 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  42.92 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  35.57 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  38.16 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  38.16 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  38.31 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  34.86 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  37.55 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  37.83 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.86 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  38.92 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  37.22 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  39.44 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  35.71 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  34.2 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  38.21 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  38.92 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  36.87 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  33.74 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  35.8 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  38.36 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.86 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  38.73 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  36.82 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.03 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  34.47 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.7 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  39.83 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  33.33 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  35.44 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>