More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1022 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  100 
 
 		 219 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  87.21 
 
 		 219 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  87.21 
 
 		 219 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  65.12 
 
 		 215 aa  298  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  63.72 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  64.19 
 
 		 215 aa  292  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  62.33 
 
 		 223 aa  291  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  61.64 
 
 		 223 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  63.72 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  50 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.77 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  50.48 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  49.01 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  48.51 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  42.59 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  47.26 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  48.22 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  44.55 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  48.44 
 
 		 258 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  46.77 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  48.97 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  49.22 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  45.54 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  48.44 
 
 		 254 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  46.34 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.45 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  47.34 
 
 		 219 aa  188  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.34 
 
 		 219 aa  188  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  47.67 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  45.02 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.44 
 
 		 274 aa  187  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  48.44 
 
 		 260 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  44.33 
 
 		 211 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  44.55 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  45.54 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  51.1 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  48.92 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.54 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.42 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  48.19 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  47.92 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  46.23 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  46.88 
 
 		 260 aa  184  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.55 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.59 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  48.66 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  44.29 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  45.92 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  45.24 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  46.88 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.51 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.13 
 
 		 214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  45.27 
 
 		 248 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  46.19 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  47.4 
 
 		 248 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.28 
 
 		 258 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.88 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  48.13 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  47.34 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.79 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  44.85 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  43.78 
 
 		 256 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  48.68 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  43.6 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.13 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  48.9 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  44.02 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  47.67 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  44.56 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.4 
 
 		 268 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  51.37 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  45.27 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  44.02 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  44.61 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.9 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  45.15 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  44.12 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  44.12 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.52 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  42.86 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  44.5 
 
 		 249 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  45.92 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  42.58 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  45.92 
 
 		 228 aa  177  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  48.66 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  46.08 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  48.62 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  47.15 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  47.06 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.79 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  41.71 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  47.15 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  44.04 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>