More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1020 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 743 aa  1526    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  81.9 
 
 		 727 aa  1215    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  81.9 
 
 		 727 aa  1215    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  37.77 
 
 		 912 aa  475  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  39.75 
 
 		 901 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  37.77 
 
 		 905 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  35.21 
 
 		 865 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 897 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  37.77 
 
 		 896 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  37.77 
 
 		 897 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  37.62 
 
 		 897 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  37.77 
 
 		 897 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  37.77 
 
 		 897 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  37.62 
 
 		 900 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  37.44 
 
 		 647 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  37.15 
 
 		 914 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 836 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  35.02 
 
 		 830 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  35.02 
 
 		 832 aa  393  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  35.12 
 
 		 837 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  34.97 
 
 		 837 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 839 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  34.67 
 
 		 834 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  34.67 
 
 		 820 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  34.67 
 
 		 846 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  34.52 
 
 		 835 aa  379  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  34.52 
 
 		 834 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.25 
 
 		 791 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 794 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.52 
 
 		 730 aa  369  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  33.04 
 
 		 754 aa  336  9e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.04 
 
 		 879 aa  330  4e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  32.54 
 
 		 750 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.18 
 
 		 765 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.32 
 
 		 623 aa  300  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 667 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33.05 
 
 		 680 aa  297  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.22 
 
 		 680 aa  296  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 795 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  32.18 
 
 		 680 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  31.8 
 
 		 773 aa  295  3e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 673 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 673 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  31.8 
 
 		 679 aa  294  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 680 aa  294  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 680 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.63 
 
 		 680 aa  291  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  31.53 
 
 		 679 aa  289  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 		 828 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.02 
 
 		 727 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 727 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 829 aa  279  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.4 
 
 		 905 aa  275  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 		 705 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  29.61 
 
 		 824 aa  273  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  30.26 
 
 		 706 aa  273  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  29.97 
 
 		 761 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  30.23 
 
 		 705 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  30.74 
 
 		 746 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  30.23 
 
 		 705 aa  271  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  30.23 
 
 		 705 aa  271  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  30.23 
 
 		 705 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  30.08 
 
 		 705 aa  270  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  30.23 
 
 		 705 aa  269  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  30.71 
 
 		 746 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  31.87 
 
 		 709 aa  263  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  28.69 
 
 		 941 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  29.97 
 
 		 705 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  31.99 
 
 		 775 aa  259  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  29 
 
 		 880 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.77 
 
 		 743 aa  258  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  29.46 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  28.02 
 
 		 843 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 		 814 aa  250  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  30.08 
 
 		 773 aa  246  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  30.1 
 
 		 830 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  29.44 
 
 		 918 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  30.43 
 
 		 820 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  29.42 
 
 		 721 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  29.2 
 
 		 649 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  28.59 
 
 		 661 aa  235  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  29.78 
 
 		 683 aa  234  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  30.63 
 
 		 683 aa  234  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  29.98 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 		 676 aa  231  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 683 aa  231  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 683 aa  230  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  30.12 
 
 		 683 aa  230  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  30.12 
 
 		 683 aa  230  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 683 aa  229  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 683 aa  228  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 683 aa  228  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  30.12 
 
 		 683 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  29.3 
 
 		 683 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  29.29 
 
 		 648 aa  226  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  29.25 
 
 		 916 aa  225  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  28.1 
 
 		 681 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  27.96 
 
 		 701 aa  221  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27 
 
 		 687 aa  218  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  29.05 
 
 		 714 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>