More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0953 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0953  peptide ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 333 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.54 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000559145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.54 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.242688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0350  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  37.38 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0021  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  35.28 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00143513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0753  nickel transporter permease NikB  35.35 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0803  nickel transporter permease NikB  35.03 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 		 306 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1978  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 		 314 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 		 313 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3533  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  31.6 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0408  peptide ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 319 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.599742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  31.49 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0644  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  31.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  31.17 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0351  peptide ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  32.04 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  34.18 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 		 316 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  31.17 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  37.38 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.65 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 		 311 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.396259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  31.49 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  31.49 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  30.84 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  33.86 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0469  nickel ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  31.49 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0219662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2276  nickel transporter permease NikB  32.8 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  30.1 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2031  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.381274  normal  0.768388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  34.38 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  33.44 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7614  nickel transporter permease NikB  33.86 
 
 		 314 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 		 306 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 		 313 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.856468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4817  nickel transporter permease NikB  33.22 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  33.86 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.86 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  31.17 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03326  nickel transporter subunit  32.9 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0238  nickel ABC transporter, permease subunit NikB  32.9 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3844  nickel transporter permease NikB  32.9 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3676  nickel transporter permease NikB  32.9 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03279  hypothetical protein  32.9 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0239  nickel transporter permease NikB  32.9 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3959  nickel transporter permease NikB  32.9 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0388  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4215  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.36 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3761  nickel transporter permease NikB  32.57 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  33.23 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13220  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  30.49 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>