100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0928 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0928  transcriptional antiterminator LicT, putative  100 
 
 		 282 aa  566  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1419  transcription antiterminator  61.57 
 
 		 283 aa  351  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.266427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1446  CAT RNA-binding domain-containing protein  61.57 
 
 		 283 aa  351  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000104494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3792  BigG family transcription antiterminator  44.37 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0611952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4118  transcription antiterminator GlcT  44.01 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1078  transcription antiterminator GlcT  43.66 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000114495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4182  transcription antiterminator GlcT  44.01 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3807  BigG family transcription antiterminator  44.01 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4071  transcription antiterminator GlcT  43.66 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3961  transcription antiterminator GlcT  43.66 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.222573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4270  transcription antiterminator GlcT  43.66 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3880  transcriptional antiterminator, BglG  43.66 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00851462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4160  transcription antiterminator GlcT  43.31 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000367123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2750  transcriptional antiterminator, BglG  43.88 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00540067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1784  transcriptional antiterminator, BglG  38.83 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0910  transcriptional antiterminator, BglG  41.64 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0069  transcription antiterminator  32.47 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0091  SACPA operon antiterminator (sacT)  32.47 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1460  transcriptional antiterminator, BglG  28.73 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000872173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0414  transcriptional antiterminator, BglG  31.14 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4271  transcriptional antiterminator BglG  27.94 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4233  transcriptional antiterminator BglG  27.94 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3937  transcriptional antiterminator BglG  27.94 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4244  transcriptional antiterminator, BglG  27.94 
 
 		 278 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03551  hypothetical protein  27.94 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03607  transcriptional antiterminator of the bgl operon  27.94 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3480  transcriptional antiterminator, BglG  31.62 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0900  beta-glucoside operon antiterminator  27.34 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1328  transcriptional antiterminator, BglG  28.32 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3508  transcriptional antiterminator, BglG  31.32 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2325  transcriptional antiterminator, BglG  28.94 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1406  transcriptional antiterminator, BglG  28.46 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1546  beta-glucoside operon antiterminator  30 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1703  transcriptional antiterminator, BglG  28.99 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00651632  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1758  beta-glucoside operon antiterminator  26.55 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.798018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0742  transcriptional antiterminator, BglG  28.11 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2440  transcriptional antiterminator, BglG  30.26 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000609251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0333  transcriptional antiterminator, BglG  28.73 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3469  transcriptional antiterminator, BglG  29.56 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000622691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0746  transcriptional antiterminator, BglG  27.94 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2743  transcriptional antiterminator, BglG  30.26 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00574761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1666  transcriptional antiterminator, BglG  28.25 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000414905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0783  transcriptional antiterminator, BglG  28.47 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000203028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1756  beta-glucoside operon antiterminator  28.67 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000280002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0759  transcriptional antiterminator, BglG  28.84 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0762  transcriptional antiterminator, BglG  29.26 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0978  transcriptional antiterminator, BglG  28.12 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0876  BigG family transcription antiterminator  27.84 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2549  transcriptional antiterminator, BglG  29.96 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2741  transcriptional antiterminator, BglG  27.21 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1890  transcriptional antiterminator, BglG  26.67 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0093026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3966  transcriptional antiterminator, BglG  26.55 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0858  BglG family transcriptional antiterminator  27.47 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2962  putative transcriptional antiterminator  31.51 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2960  transcriptional antiterminator, BglG  25.71 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000296432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1049  transcriptional antiterminator, BglG  24.72 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0789  transcriptional antiterminator LicT  27.34 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0221809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0473  transcriptional antiterminator, BglG  25.64 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0915311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1347  transcriptional antiterminator, BglG  23.05 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1354  transcriptional antiterminator, BglG  26.5 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0888  transcriptional antiterminator, BglG  25.18 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0499  beta-glucoside operon antiterminator  25.63 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000340266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4205  cryptic beta-glucoside bgl operon antiterminator  31.85 
 
 		 164 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1670  transcriptional antiterminator  25.98 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0701104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0341  beta-glucoside operon antiterminator  23.86 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223253  hitchhiker  0.0000011111 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0391  PRD domain-containing protein  27.53 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0531  transcriptional antiterminator, BglG  25 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.849471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0381  transcriptional antiterminator, BglG  27.53 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3395  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  29.29 
 
 		 661 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1587  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  28.8 
 
 		 625 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2720  PRD domain-containing protein  35.44 
 
 		 624 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2664  transcriptional antiterminator, BglG  35.44 
 
 		 624 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1846  transcriptional antiterminator, BglG  32.58 
 
 		 685 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1169  transcriptional antiterminator, BglG  28.4 
 
 		 648 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00649229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0929  transcriptional antiterminator  21.83 
 
 		 663 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1683  PTS modulated transcriptional regulator, MtlR family  23.46 
 
 		 646 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0120  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  27.82 
 
 		 977 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0269  transcriptional antiterminator, BglG  29.87 
 
 		 680 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  34.55 
 
 		 652 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20170  transcriptional antiterminator, BglG  27.5 
 
 		 741 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0701  transcriptional antiterminator, BglG  24.19 
 
 		 646 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2259  BglG family transcriptional antiterminator  26.13 
 
 		 623 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0221  transcriptional antiterminator, BglG  27.27 
 
 		 674 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0843  transcription antiterminator, BglG family  23.91 
 
 		 646 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0686  BigG family transcription antiterminator  23.38 
 
 		 646 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2227  PRD domain-containing protein  26.7 
 
 		 710 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2189  transcriptional antiterminator, BglG  26.7 
 
 		 710 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0881  BigG family transcription antiterminator  29.36 
 
 		 643 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.441877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4493  transcription antiterminator, BglG family  29.36 
 
 		 646 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0226696  hitchhiker  0.0000000000157823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0952  transcription antiterminator, BglG family  23.04 
 
 		 646 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0883  transcription antiterminator, BglG family  26.97 
 
 		 646 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.28346e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0751  BigG family transcription antiterminator  26.97 
 
 		 646 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0699  BigG family transcription antiterminator  26.97 
 
 		 646 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0790  BigG family transcription antiterminator  26.97 
 
 		 646 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2133  PTS system transcriptional activator  27.63 
 
 		 892 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4699  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 637 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.613888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4730  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 637 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.398231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4828  HTH domain-containing protein  31.25 
 
 		 637 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4794  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 637 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4849  transcriptional antiterminator, BglG  31.25 
 
 		 637 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>