198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0918 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1009 aa  2002    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  44.7 
 
 		 1009 aa  802    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  44.7 
 
 		 1009 aa  802    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  27.35 
 
 		 1029 aa  327  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  27.91 
 
 		 1029 aa  326  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  26.92 
 
 		 1029 aa  321  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  27.31 
 
 		 1029 aa  321  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  26.69 
 
 		 1029 aa  318  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.33 
 
 		 1029 aa  318  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.24 
 
 		 1029 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  26.56 
 
 		 1029 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.24 
 
 		 1029 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.24 
 
 		 1029 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.24 
 
 		 1029 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  29.11 
 
 		 1039 aa  290  9e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  26.56 
 
 		 1018 aa  280  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 		 1018 aa  280  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  26.7 
 
 		 1018 aa  266  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  26.89 
 
 		 1018 aa  258  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  25.65 
 
 		 953 aa  252  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  41.91 
 
 		 1030 aa  171  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  48.5 
 
 		 1020 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  50.9 
 
 		 1018 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  50.9 
 
 		 1018 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  50.9 
 
 		 1018 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  50.9 
 
 		 1018 aa  166  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  37.31 
 
 		 1018 aa  164  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  44.67 
 
 		 1018 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  36.94 
 
 		 1018 aa  163  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  49.4 
 
 		 1018 aa  162  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  36.4 
 
 		 1018 aa  160  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  41.47 
 
 		 1081 aa  159  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  45.4 
 
 		 1018 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  40.29 
 
 		 881 aa  157  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  51.18 
 
 		 1013 aa  157  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  47.2 
 
 		 1025 aa  153  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  39.11 
 
 		 1038 aa  146  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  43.83 
 
 		 1291 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  33.56 
 
 		 1020 aa  145  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  33.49 
 
 		 1047 aa  144  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  46.75 
 
 		 1020 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  46.51 
 
 		 1017 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  42.5 
 
 		 995 aa  137  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  46.58 
 
 		 986 aa  134  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  47.8 
 
 		 1023 aa  134  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  42.86 
 
 		 1022 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  42.37 
 
 		 1033 aa  133  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  40.74 
 
 		 1046 aa  132  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  36.07 
 
 		 986 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  39.79 
 
 		 1049 aa  131  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.75 
 
 		 1059 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  45.4 
 
 		 1249 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  25.64 
 
 		 1091 aa  129  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  31.38 
 
 		 995 aa  128  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  24.73 
 
 		 1018 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  41.84 
 
 		 989 aa  127  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  49.35 
 
 		 962 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  45 
 
 		 1009 aa  125  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  31.79 
 
 		 1006 aa  125  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  23.72 
 
 		 906 aa  124  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  24.91 
 
 		 1024 aa  123  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  34.88 
 
 		 1046 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  27.66 
 
 		 1011 aa  122  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  41.95 
 
 		 1191 aa  121  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  41.67 
 
 		 1058 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  43.04 
 
 		 1101 aa  115  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  33.67 
 
 		 1223 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  35.86 
 
 		 1091 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  36.06 
 
 		 1230 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  40.1 
 
 		 1307 aa  113  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  28.27 
 
 		 1223 aa  112  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  39.62 
 
 		 1219 aa  111  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  42.07 
 
 		 1085 aa  111  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 		 1224 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  44.2 
 
 		 1214 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  44.2 
 
 		 1214 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  38.5 
 
 		 1303 aa  109  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  41.11 
 
 		 1346 aa  109  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  43.8 
 
 		 1214 aa  108  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  43.8 
 
 		 1214 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  43.8 
 
 		 1214 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  43.8 
 
 		 1214 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  34.96 
 
 		 1144 aa  107  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  47.45 
 
 		 1247 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  45.89 
 
 		 1238 aa  106  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  41.1 
 
 		 1213 aa  105  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  43.8 
 
 		 1226 aa  104  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  48.28 
 
 		 1211 aa  104  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  48.28 
 
 		 1211 aa  104  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.51 
 
 		 1234 aa  102  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  40.67 
 
 		 1226 aa  101  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  43.57 
 
 		 1137 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  35.98 
 
 		 910 aa  99  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  44.85 
 
 		 1227 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  44.85 
 
 		 1227 aa  96.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  42.65 
 
 		 1048 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  34.3 
 
 		 1220 aa  95.5  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  42.65 
 
 		 1047 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  42.65 
 
 		 1047 aa  95.5  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  34.3 
 
 		 1229 aa  95.5  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>