More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0897 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0897  homoserine dehydrogenase  100 
 
 
426 aa  855    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  80.99 
 
 
426 aa  706    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  80.99 
 
 
426 aa  706    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  49.57 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 
431 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  49.85 
 
 
431 aa  322  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  49.25 
 
 
417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  49.25 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  49.25 
 
 
417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  49.25 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  49.25 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  49.55 
 
 
431 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  49.25 
 
 
431 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  47.83 
 
 
432 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  49.25 
 
 
431 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  46.52 
 
 
431 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 
431 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  45.96 
 
 
431 aa  312  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 
431 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 
431 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  45.68 
 
 
431 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  47.06 
 
 
431 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  49.04 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  50.16 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  50.16 
 
 
431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  41.55 
 
 
432 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  45.25 
 
 
432 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  47.28 
 
 
429 aa  292  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  42.35 
 
 
427 aa  286  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  45.91 
 
 
428 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  44.79 
 
 
428 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0786  homoserine dehydrogenase  47.15 
 
 
425 aa  281  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  49.37 
 
 
418 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  44.03 
 
 
440 aa  279  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  48.4 
 
 
431 aa  279  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0125  homoserine dehydrogenase  41.03 
 
 
436 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1806  homoserine dehydrogenase  43.82 
 
 
443 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149536  hitchhiker  0.00453238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2381  homoserine dehydrogenase  43.24 
 
 
443 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0434053  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  44.03 
 
 
436 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  43.15 
 
 
439 aa  270  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  42.07 
 
 
427 aa  269  8e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  44.41 
 
 
424 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  43.4 
 
 
436 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  43.9 
 
 
432 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0904  homoserine dehydrogenase  39.4 
 
 
437 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1048  homoserine dehydrogenase  39.4 
 
 
437 aa  265  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  42.45 
 
 
436 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  46.51 
 
 
432 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2114  homoserine dehydrogenase  45.25 
 
 
435 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0831513 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6225  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 
442 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1854  homoserine dehydrogenase  40.66 
 
 
442 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  42.14 
 
 
436 aa  264  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2578  homoserine dehydrogenase  40.49 
 
 
435 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1452  homoserine dehydrogenase  44.94 
 
 
414 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0556341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1878  homoserine dehydrogenase  40.38 
 
 
442 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0688799  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1238  homoserine dehydrogenase  40.44 
 
 
444 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1419  homoserine dehydrogenase  42.06 
 
 
442 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470223  normal  0.0359318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  42.77 
 
 
436 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1966  homoserine dehydrogenase  40.17 
 
 
436 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  41.51 
 
 
438 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1792  homoserine dehydrogenase  42.11 
 
 
442 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  41.96 
 
 
428 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1993  homoserine dehydrogenase  39.89 
 
 
436 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0931  homoserine dehydrogenase  41.64 
 
 
443 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.516098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5155  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 
442 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.350686  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2731  homoserine dehydrogenase  43.71 
 
 
429 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1764  homoserine dehydrogenase  42.23 
 
 
442 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1027  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 
434 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4149  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 
434 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490184  normal  0.418936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0438  homoserine dehydrogenase  38.8 
 
 
436 aa  255  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0445  Homoserine dehydrogenase  39.32 
 
 
436 aa  255  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.68912  normal  0.720886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16070  homoserine dehydrogenase  40.22 
 
 
434 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2090  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5219  homoserine dehydrogenase  41.39 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.697669  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  40.75 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  44.18 
 
 
420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  46.03 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1470  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4251  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474195  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  43.08 
 
 
441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1075  homoserine dehydrogenase  39.12 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.23224  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1822  homoserine dehydrogenase  43.04 
 
 
437 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3388  Homoserine dehydrogenase  43.67 
 
 
430 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2274  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 
433 aa  253  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  43.44 
 
 
435 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0286  homoserine dehydrogenase  42.02 
 
 
433 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  42.36 
 
 
427 aa  252  9.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  42.81 
 
 
438 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1831  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 
440 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3765  homoserine dehydrogenase  40.64 
 
 
433 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524334  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1383  homoserine dehydrogenase  39.67 
 
 
434 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00178253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2025  homoserine dehydrogenase  40.29 
 
 
438 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1290  homoserine dehydrogenase  39.94 
 
 
463 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0555525  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  41.44 
 
 
434 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>