178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0891 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  69.1 
 
 		 190 aa  243  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  69.1 
 
 		 190 aa  243  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  39.57 
 
 		 258 aa  117  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  43.26 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  45.38 
 
 		 276 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  40.74 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  41.79 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  41.79 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  38.81 
 
 		 408 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  39.29 
 
 		 271 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  38.52 
 
 		 350 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  42.65 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  47.06 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  40.77 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  39.26 
 
 		 351 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  42.75 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  43.75 
 
 		 323 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  37.31 
 
 		 346 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  37.84 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  35.62 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  33.33 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  42.19 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  42.99 
 
 		 382 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  33.73 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  39.37 
 
 		 284 aa  91.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  42.97 
 
 		 266 aa  91.3  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  40.74 
 
 		 374 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  41.73 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  34.32 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  41.73 
 
 		 231 aa  87.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  33.51 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  34.71 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.84 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  40.16 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  40.16 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  35.66 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  32.64 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  36.3 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  33.59 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  33.85 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  38.52 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  37.12 
 
 		 286 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  41.41 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  38.4 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  35.92 
 
 		 282 aa  74.7  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  36.3 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  37.1 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  33.14 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  31.78 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 293 aa  72  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  38.6 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 273 aa  70.9  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  28.79 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  33.09 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.84 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  35.71 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.01 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  30.53 
 
 		 260 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.01 
 
 		 255 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  31.5 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  31.3 
 
 		 259 aa  67  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.83 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  33.85 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  30.25 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  35.25 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.08 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  27.56 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  31.78 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.06 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  30.23 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  31.08 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.16 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.74 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.74 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  36.79 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.95 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  33.85 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.75 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  30.43 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  29.37 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  30.08 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  33.07 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.71 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  27.56 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  32.31 
 
 		 388 aa  57.8  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  26.02 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  33.7 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  30 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  30.43 
 
 		 288 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.85 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  28.35 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>