More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0869 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
308 aa  636    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 
305 aa  346  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 
305 aa  346  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  34.09 
 
 
313 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  33.67 
 
 
304 aa  180  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  30.98 
 
 
307 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  31.31 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
307 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  30.64 
 
 
307 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  30.46 
 
 
307 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  30.72 
 
 
316 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  32.86 
 
 
306 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  31.88 
 
 
307 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  31.88 
 
 
307 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  30.33 
 
 
307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  30.33 
 
 
307 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
324 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 
308 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  30.07 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
314 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
326 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  27.34 
 
 
313 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
314 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 
314 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
327 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 
314 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
314 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
306 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  32.28 
 
 
310 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  28.66 
 
 
312 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  30.93 
 
 
310 aa  139  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
314 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  29.43 
 
 
301 aa  132  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  28.42 
 
 
308 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
309 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  25.64 
 
 
291 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  27.85 
 
 
334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  28.77 
 
 
309 aa  124  1e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  24.33 
 
 
314 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  26.33 
 
 
314 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  26.33 
 
 
323 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  26.52 
 
 
316 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  23.67 
 
 
314 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 
335 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  28.52 
 
 
308 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.35 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  24.91 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  24.67 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  25.35 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  21.58 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.73 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  23.97 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  24.43 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  24.05 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  20.73 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  21.45 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  20.65 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  21.45 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  23.77 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  30.57 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  22.6 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  20.97 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  22.45 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  24.34 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  19.64 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  23.68 
 
 
301 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>