298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0851 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  100 
 
 
382 aa  781    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  62.37 
 
 
383 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  62.37 
 
 
383 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.09 
 
 
416 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  41.73 
 
 
412 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  39.51 
 
 
414 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  41.23 
 
 
412 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  40.44 
 
 
412 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  40.44 
 
 
412 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  40.99 
 
 
412 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  40.44 
 
 
412 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  40.44 
 
 
412 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  40.64 
 
 
412 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 
412 aa  265  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  40.49 
 
 
412 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  37.66 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.94 
 
 
415 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.58 
 
 
412 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  34.06 
 
 
412 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  42.02 
 
 
411 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  31.45 
 
 
432 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  32.01 
 
 
420 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.7 
 
 
413 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  32.59 
 
 
411 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  42.74 
 
 
423 aa  203  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  37.81 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  32.6 
 
 
416 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  29.78 
 
 
415 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  33.23 
 
 
391 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1643  competence/damage-inducible protein CinA  36.18 
 
 
393 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  32.17 
 
 
413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  37.09 
 
 
416 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  32.75 
 
 
417 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  32.34 
 
 
393 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  37.06 
 
 
416 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  31.93 
 
 
420 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  34.15 
 
 
406 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.83 
 
 
413 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  34 
 
 
425 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  36.01 
 
 
416 aa  179  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.76 
 
 
431 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  33.87 
 
 
425 aa  176  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  32.54 
 
 
395 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  29.55 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  34.31 
 
 
418 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3616  competence/damage-inducible protein CinA  34.81 
 
 
416 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  36.52 
 
 
421 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  28.99 
 
 
408 aa  169  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.56 
 
 
429 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  36.08 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  31.95 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  34.25 
 
 
420 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  30.95 
 
 
406 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.01 
 
 
430 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  34.42 
 
 
419 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  35.52 
 
 
430 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.58 
 
 
433 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  31.25 
 
 
419 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  29.55 
 
 
423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  34.39 
 
 
424 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  29.62 
 
 
429 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  31.1 
 
 
372 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  34.95 
 
 
408 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  34.63 
 
 
408 aa  149  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  30.25 
 
 
418 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.94 
 
 
424 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  26.92 
 
 
392 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  31.72 
 
 
438 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  29.31 
 
 
419 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  33.02 
 
 
415 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  32.4 
 
 
427 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  32.11 
 
 
433 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 
410 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  29.58 
 
 
408 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  31.1 
 
 
418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  33.18 
 
 
408 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  23.06 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  29.43 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  30.1 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.82 
 
 
408 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  32.06 
 
 
423 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  29.55 
 
 
431 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  36.63 
 
 
443 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  31.65 
 
 
401 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  25.72 
 
 
412 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 
415 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  28.12 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  29.94 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  31.82 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.22 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  23.54 
 
 
413 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  22.93 
 
 
414 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  23.41 
 
 
414 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  29.8 
 
 
265 aa  123  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  30.71 
 
 
415 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.72 
 
 
408 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>