293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0842 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0842  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
568 aa  1155    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1335  beta-lactamase domain-containing protein  93.42 
 
 
574 aa  1088    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.547881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  93.42 
 
 
574 aa  1088    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 
556 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 
556 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 
556 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 
556 aa  622  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 
556 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 
556 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 
556 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  51.99 
 
 
556 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  51.62 
 
 
556 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  51.5 
 
 
583 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  51.81 
 
 
556 aa  621  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  51.45 
 
 
556 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  51.54 
 
 
555 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  44.93 
 
 
555 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  44.57 
 
 
555 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  44.75 
 
 
555 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  44.75 
 
 
555 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  44.75 
 
 
555 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.38 
 
 
555 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.75 
 
 
555 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  44.75 
 
 
555 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  44.57 
 
 
555 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.38 
 
 
555 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  44.75 
 
 
555 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  45.11 
 
 
555 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  44 
 
 
555 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  44.42 
 
 
554 aa  514  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  44.7 
 
 
558 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 
566 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  44.02 
 
 
554 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  42.93 
 
 
554 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  44.4 
 
 
551 aa  505  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0649  beta-lactamase domain-containing protein  43.56 
 
 
593 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000403625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  43.8 
 
 
553 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  43.66 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  44.38 
 
 
555 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  44.5 
 
 
555 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.98 
 
 
555 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  42.34 
 
 
555 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  43.25 
 
 
560 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
553 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 
559 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  41.23 
 
 
555 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  40.22 
 
 
557 aa  475  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1152  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.18 
 
 
553 aa  478  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1170  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.65 
 
 
591 aa  474  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.811184  hitchhiker  0.000000000000102391 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1186  metallo-beta-lactamase superfamily protein  42.18 
 
 
553 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  39.32 
 
 
557 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  39.5 
 
 
557 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  39.32 
 
 
557 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  40.54 
 
 
555 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.56 
 
 
557 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1727  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.71 
 
 
570 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.5 
 
 
557 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.24 
 
 
555 aa  465  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  39.45 
 
 
557 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0625  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  41.16 
 
 
609 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.84 
 
 
557 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  39.49 
 
 
561 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.96 
 
 
557 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 
560 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38.06 
 
 
559 aa  457  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 
565 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  39.09 
 
 
565 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 
618 aa  451  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  38.32 
 
 
551 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  38.32 
 
 
551 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  38.32 
 
 
551 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  38.22 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 
558 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  39.6 
 
 
618 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38 
 
 
560 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38.63 
 
 
560 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  39.6 
 
 
558 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1282  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  39.53 
 
 
636 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 
552 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.2 
 
 
559 aa  432  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  39.05 
 
 
558 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  38.6 
 
 
573 aa  431  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  38.77 
 
 
553 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  37.45 
 
 
548 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  38.69 
 
 
558 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 
556 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 
591 aa  422  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 
593 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 
557 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  36.68 
 
 
547 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  37.71 
 
 
533 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 
561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 
561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 
561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  36.18 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  37.59 
 
 
564 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  37.07 
 
 
569 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  37.41 
 
 
549 aa  399  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  33.63 
 
 
569 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl570  putative metallo-beta lactamase hydrolase  35.73 
 
 
588 aa  384  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00258207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>