More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0832 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0832  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  313  8e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0955131  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1325  hypothetical protein  80.65 
 
 
155 aa  268  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1351  hypothetical protein  80.65 
 
 
155 aa  268  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  53.64 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  51.63 
 
 
156 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  168  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  168  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  168  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  168  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  51.66 
 
 
156 aa  168  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  50.98 
 
 
156 aa  166  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  50.99 
 
 
156 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  51.63 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  49.67 
 
 
157 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  46.45 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  48.34 
 
 
157 aa  151  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  43.51 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  47.44 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  42.21 
 
 
153 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  39.33 
 
 
158 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  45.89 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  43.54 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  44.16 
 
 
159 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  42 
 
 
154 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  41.26 
 
 
154 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  44.16 
 
 
151 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  45.53 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  39.46 
 
 
155 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0379  hypothetical protein  41.83 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000399241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  39.33 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  38.82 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  35.53 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0813  hypothetical protein  41.67 
 
 
157 aa  108  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000388693  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  39.69 
 
 
166 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  38.41 
 
 
159 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  35.95 
 
 
171 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  35.95 
 
 
171 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  36.99 
 
 
156 aa  103  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  35.95 
 
 
171 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  36.42 
 
 
159 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  37.58 
 
 
159 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  34.81 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  39.17 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  39.17 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  38.33 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  38.33 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.33 
 
 
169 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  37.09 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  35.83 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  39.17 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  39.17 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  34.46 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  33.85 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  30.56 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  34.87 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  42.86 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  33.83 
 
 
191 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  38.1 
 
 
165 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0377  hypothetical protein  39.52 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.467717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34.29 
 
 
153 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  33.08 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  33.08 
 
 
154 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  36.64 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  29.61 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  33.83 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  32.67 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  29.61 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  33.08 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  35.53 
 
 
160 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  35.48 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  30.77 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  32.31 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  34.78 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  32.33 
 
 
154 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  35.1 
 
 
154 aa  89  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  37.39 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.58 
 
 
151 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  36.52 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  32.24 
 
 
162 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  31.75 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  34.69 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  30.83 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1359  hypothetical protein  35.9 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0045809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  35.1 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>