More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0783 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0783  sun protein  100 
 
 		 435 aa  900    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  72.41 
 
 		 435 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  72.41 
 
 		 435 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  44.92 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  40.45 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  42.25 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  41.99 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  42.44 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  42.21 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  42.44 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  41.99 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  41.99 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  42.21 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  41.99 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  42.21 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  41.99 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  40.63 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.5 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  40.27 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  37.67 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.24 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  40.5 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.88 
 
 		 442 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  38.06 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  36.43 
 
 		 442 aa  299  6e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  35.41 
 
 		 457 aa  299  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  36 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  36.36 
 
 		 452 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  37.59 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  34.61 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.39 
 
 		 424 aa  289  6e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  39 
 
 		 440 aa  286  4e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  36.22 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.13 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.89 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  33.48 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  33.26 
 
 		 462 aa  265  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.41 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  31.82 
 
 		 446 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.71 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  36.47 
 
 		 453 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31.31 
 
 		 451 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.21 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  31.66 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.71 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.31 
 
 		 451 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  29.82 
 
 		 456 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  29.44 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  31.64 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 		 449 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.77 
 
 		 446 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  35.73 
 
 		 428 aa  243  3e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.64 
 
 		 443 aa  239  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  30.54 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.68 
 
 		 406 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  31.42 
 
 		 464 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  33.16 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  31.25 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  29.91 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  30.34 
 
 		 468 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  29.73 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.27 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  31.35 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  31.36 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  34 
 
 		 430 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2201  Fmu (Sun) domain protein  32.57 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.256814  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  31.09 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  28.78 
 
 		 452 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  29.28 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  28.04 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  31.87 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  27.99 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  29.5 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.93 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  31.45 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  31.35 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  31.4 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  30.43 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  30.93 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  31.29 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  27.99 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  29.66 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  32.43 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  30.93 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  31.22 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  30.7 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.18 
 
 		 429 aa  196  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  29.38 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  29.78 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  30.05 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  30.66 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  30.45 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  28.94 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  27.85 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  30.09 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0853  Fmu (Sun) domain protein  30.89 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  30.8 
 
 		 426 aa  189  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  30.54 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  30.37 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  30.09 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>