More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0782 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
310 aa  631  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  74.92 
 
 
311 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  74.92 
 
 
311 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  54.25 
 
 
318 aa  341  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  54.13 
 
 
314 aa  340  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  54.46 
 
 
314 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  53.47 
 
 
314 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  53.14 
 
 
314 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  53.14 
 
 
314 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  54.25 
 
 
311 aa  329  3e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  52.61 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  51.31 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  47.33 
 
 
314 aa  286  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  45.7 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  47.77 
 
 
323 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  46.49 
 
 
311 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  46.71 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  45.07 
 
 
317 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  44.82 
 
 
311 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  45.33 
 
 
318 aa  271  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  45 
 
 
318 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  44 
 
 
317 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  44.3 
 
 
319 aa  268  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  44.66 
 
 
313 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 
359 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 
321 aa  265  7e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 
312 aa  260  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  41.1 
 
 
308 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  44.33 
 
 
316 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  44.23 
 
 
312 aa  258  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 
255 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  40.73 
 
 
315 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  43.67 
 
 
311 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  41.61 
 
 
313 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  42.3 
 
 
315 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  43.61 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  43.32 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 
315 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  42.28 
 
 
315 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.98 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  44.88 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  44.66 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  40.66 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1172  methionyl-tRNA formyltransferase  46.51 
 
 
317 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 
313 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 
313 aa  250  3e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 
332 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  45.87 
 
 
310 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 
315 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 
309 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 
310 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 
314 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  41.32 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 
320 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  39.16 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  43.04 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 
315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 
330 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 
315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 
315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 
315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 
315 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 
310 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 
310 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 
318 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.99 
 
 
315 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 
312 aa  242  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 
323 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 
369 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.28 
 
 
318 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  41.95 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  41.5 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.6 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 
314 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  41.81 
 
 
320 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 
318 aa  238  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
319 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 
309 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
314 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>