49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0761 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  322  9e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  53.27 
 
 		 265 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  53.27 
 
 		 265 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  52.34 
 
 		 266 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  47.66 
 
 		 157 aa  114  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  47.66 
 
 		 324 aa  110  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  52.34 
 
 		 257 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  52.34 
 
 		 257 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  45.16 
 
 		 267 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  45.16 
 
 		 267 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2370  CHAP domain-containing protein  48.6 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.918618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2327  CHAP domain-containing protein  48.6 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  48.6 
 
 		 255 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  48.6 
 
 		 255 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  31.76 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  31.76 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  41.51 
 
 		 279 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  41.51 
 
 		 279 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  30.41 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  49.53 
 
 		 334 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  49.53 
 
 		 334 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  40.18 
 
 		 266 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  33.04 
 
 		 449 aa  73.9  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  31.43 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.78 
 
 		 655 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.7 
 
 		 619 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.7 
 
 		 619 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  36.84 
 
 		 582 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  32.43 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  31.86 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  31.53 
 
 		 512 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  40 
 
 		 455 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  35.85 
 
 		 397 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  35.96 
 
 		 390 aa  57  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.7 
 
 		 574 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  38.2 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  33.61 
 
 		 499 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  31.3 
 
 		 482 aa  54.3  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  31.96 
 
 		 933 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  27.59 
 
 		 468 aa  51.2  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3502  CHAP domain-containing protein  37.21 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  31.58 
 
 		 302 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  30.56 
 
 		 303 aa  47.8  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2130  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0066022  normal  0.0961309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0057  cell wall protein precursor, choline binding protein  31.43 
 
 		 279 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  30 
 
 		 562 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0046  CHAP domain containing protein  27.84 
 
 		 332 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>