More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0676 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 560 aa  1142    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.8 
 
 		 559 aa  697    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  67.09 
 
 		 555 aa  797    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  59.25 
 
 		 555 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  67.27 
 
 		 555 aa  797    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  95.18 
 
 		 565 aa  1094    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  95.18 
 
 		 565 aa  1094    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  55.28 
 
 		 618 aa  637    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  65.83 
 
 		 555 aa  780    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  66.91 
 
 		 555 aa  793    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  66.55 
 
 		 555 aa  784    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  61.15 
 
 		 561 aa  713    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  67.09 
 
 		 555 aa  796    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  55.4 
 
 		 559 aa  652    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  55.43 
 
 		 560 aa  640    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  61.71 
 
 		 560 aa  723    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  56.25 
 
 		 573 aa  622  1e-177  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  49.64 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  49.09 
 
 		 551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  51.01 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  49.37 
 
 		 556 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  48.81 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  49.55 
 
 		 556 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  49.27 
 
 		 555 aa  581  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  49.55 
 
 		 556 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 556 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 556 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 556 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  49.73 
 
 		 559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 556 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  49.64 
 
 		 554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  49.55 
 
 		 583 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 556 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  49.73 
 
 		 556 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  48.91 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  48.56 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.55 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  49.55 
 
 		 557 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  50.18 
 
 		 558 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  49.55 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  49.37 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  49.55 
 
 		 557 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.37 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.37 
 
 		 557 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  49.19 
 
 		 557 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  48.53 
 
 		 554 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  47.56 
 
 		 560 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  47.2 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  49.26 
 
 		 554 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  46.75 
 
 		 553 aa  556  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  46.84 
 
 		 554 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  47.2 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  49.45 
 
 		 618 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  48.39 
 
 		 555 aa  545  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  46.59 
 
 		 555 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl570  putative metallo-beta lactamase hydrolase  48.53 
 
 		 588 aa  534  1e-150  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00258207  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0623  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.9 
 
 		 611 aa  530  1e-149  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0867442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  46.64 
 
 		 552 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  47.14 
 
 		 591 aa  518  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  45.9 
 
 		 551 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  46.08 
 
 		 551 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  45.9 
 
 		 560 aa  513  1e-144  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  45.72 
 
 		 551 aa  515  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  44.67 
 
 		 556 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  44.79 
 
 		 558 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  43.83 
 
 		 558 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  44.36 
 
 		 557 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  42.6 
 
 		 547 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  44.1 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  43.85 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  43.8 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  42.17 
 
 		 561 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  41.99 
 
 		 561 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  42.75 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  41.5 
 
 		 593 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  42.09 
 
 		 564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  42.81 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 		 569 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  40.79 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  42.05 
 
 		 548 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  41.65 
 
 		 569 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2928  beta-lactamase domain protein  44.73 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3168  beta-lactamase domain protein  44.73 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  41.8 
 
 		 717 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  40.93 
 
 		 573 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  42.26 
 
 		 554 aa  453  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0649  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 		 593 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000403625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2917  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.29 
 
 		 591 aa  448  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1250  hypothetical protein  42.17 
 
 		 644 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3608  hypothetical protein  43.98 
 
 		 589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  39.78 
 
 		 677 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0069  hypothetical protein  42.6 
 
 		 679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>