More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0641 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0641  fmt protein  100 
 
 		 400 aa  813    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  57.39 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  57.39 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  32.5 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  31.97 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  28.68 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.92 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  30.59 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  31.66 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  31.35 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.26 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.93 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  31.03 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.61 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.61 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.91 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  27.99 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  29.18 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.05 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  27.99 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  28.48 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.72 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  27.96 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  27.96 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  28.49 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  28.23 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  28.23 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  28.23 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.4 
 
 		 446 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  32.8 
 
 		 498 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  32.8 
 
 		 498 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  33.78 
 
 		 514 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.02 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  28.74 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.04 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.15 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  25.84 
 
 		 451 aa  90.1  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.39 
 
 		 578 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.72 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  27.19 
 
 		 416 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.09 
 
 		 362 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.74 
 
 		 496 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.88 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  25.17 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  26.34 
 
 		 379 aa  86.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.52 
 
 		 529 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.79 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.55 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1627  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  24.35 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.85 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  29.87 
 
 		 1032 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  32.11 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.05 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.87 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  27.75 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.87 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  27.59 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.43 
 
 		 1055 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.98 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  30.85 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.91 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  24.8 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 483 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.41 
 
 		 526 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.64 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  33.14 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.68 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27.56 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.81 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.09 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.63 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.57 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  32.57 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  24.85 
 
 		 603 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  26.05 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  25.6 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  26.92 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.38 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  24.8 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.31 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  22.69 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.81 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25.99 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.08 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.93 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  25.87 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  24.84 
 
 		 681 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.79 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  26.77 
 
 		 591 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.54 
 
 		 567 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  22.38 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1924  beta-lactamase  24.62 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.19 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.44 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>