More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0629 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  100 
 
 		 456 aa  946    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  69.32 
 
 		 453 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  69.32 
 
 		 453 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  36.08 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  35.85 
 
 		 461 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.22 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.71 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.71 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  34 
 
 		 464 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.43 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.71 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.71 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.71 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.71 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.43 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  32.57 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.7 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  32.02 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.93 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  31.73 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  28.68 
 
 		 481 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.56 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  32.03 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.1 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.1 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  32.13 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  37.08 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  30.08 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  32.53 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  29.17 
 
 		 451 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  30.95 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.89 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.63 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.63 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  32.03 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.63 
 
 		 492 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  31.73 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  31.93 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  32.78 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  35.14 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  30.32 
 
 		 554 aa  163  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  31.84 
 
 		 452 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  31.82 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  28.7 
 
 		 428 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  30.87 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  31.44 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  30.17 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.56 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  30.11 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  28.99 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  28.12 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  30.73 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  27.95 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  27.95 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  31.64 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  28.09 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  31.46 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  29.86 
 
 		 449 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  30.56 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  33.94 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  27.51 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.2 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  30 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  29.8 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  29.76 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  33.21 
 
 		 401 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.61 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  25.52 
 
 		 483 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  32.62 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  34.7 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  30.45 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  28.72 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.3 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.71 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  34.63 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  34.51 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  29.01 
 
 		 466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  33.71 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  33.71 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  30.04 
 
 		 462 aa  146  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  30.08 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  29.4 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  30.45 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  31.71 
 
 		 394 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.84 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  28.02 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  30.08 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  28.94 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  29.23 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  29.12 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  30.83 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  30.8 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  33.46 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  33.58 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  31.62 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  32.06 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  34.17 
 
 		 407 aa  140  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  31.37 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>