More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0590 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  100 
 
 		 614 aa  1227    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  85.18 
 
 		 614 aa  1042    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  85.18 
 
 		 614 aa  1042    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  51.23 
 
 		 611 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  48.7 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  48.7 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  48.7 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  48.7 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  48.7 
 
 		 609 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  48.21 
 
 		 609 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  48.37 
 
 		 609 aa  555  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  48.53 
 
 		 609 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  48.53 
 
 		 609 aa  554  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  48.53 
 
 		 609 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  49.35 
 
 		 609 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  37.44 
 
 		 609 aa  404  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  38.95 
 
 		 608 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1038  Na+/H+ antiporter, putative  31.21 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000729524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  30.94 
 
 		 484 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00112359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1795  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 389 aa  123  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1786  sodium/hydrogen exchanger  29.52 
 
 		 402 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  29.11 
 
 		 375 aa  120  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0341  sodium/hydrogen exchanger  27.98 
 
 		 401 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.972997  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1889  sodium/hydrogen exchanger  23.35 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  28.4 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0565  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 		 385 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 		 387 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  25.68 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0897  sodium/hydrogen exchanger  26.47 
 
 		 398 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 719 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 679 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 395 aa  95.5  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0178  Na+/H+ antiporter  25.06 
 
 		 386 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 		 389 aa  94  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 751 aa  93.6  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1177  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 		 392 aa  93.2  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  25 
 
 		 386 aa  93.6  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0159  Na+/H+ antiporter  26.46 
 
 		 392 aa  92  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1900  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 557 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000133298 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1549  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.88 
 
 		 387 aa  91.7  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 		 712 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 721 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2288  radical SAM protein  28.83 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.89 
 
 		 352 aa  89.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2056  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.71 
 
 		 391 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0177  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.89 
 
 		 388 aa  89.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.193512  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  23.61 
 
 		 715 aa  88.2  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 692 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1944  Sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 		 382 aa  87.4  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  24.71 
 
 		 530 aa  87  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 389 aa  86.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  23.31 
 
 		 756 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0575  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  23.93 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.77521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1676  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.71 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 722 aa  84.7  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1852  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.68 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.24 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3791  sodium/hydrogen exchanger  25.61 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170031  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1839  sodium/hydrogen exchanger  24.36 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.212345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0334  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  25.26 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 715 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  25 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  25 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  25 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 709 aa  78.2  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  25 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  21.74 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  22.49 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  22.49 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  22.49 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  22.49 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  25 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1763  sodium/hydrogen exchanger  20.55 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  25.38 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.48 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  25 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.78 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.74 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  26.52 
 
 		 716 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.74 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  22.22 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0362  TrkA-C domain protein  26.54 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0161079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  23.86 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>