More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0561 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  75.82 
 
 
274 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  75.82 
 
 
274 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  49.81 
 
 
269 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  47.76 
 
 
268 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  49.81 
 
 
269 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  47.39 
 
 
268 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  49.81 
 
 
269 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  49.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  49.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  49.44 
 
 
269 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  49.43 
 
 
269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  35.9 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  33.71 
 
 
278 aa  152  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  32.37 
 
 
270 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  30.8 
 
 
269 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  32.73 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  30.8 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  31.37 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  30.8 
 
 
269 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  30.8 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0165  HAD hydrolase, IIB family  30.25 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.45 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  32.13 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf242  COF family HAD hydrolase protein  30 
 
 
318 aa  110  3e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00196152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  27.03 
 
 
267 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.71 
 
 
273 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.38 
 
 
268 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl614  HAD-superfamily cof-like hydrolase  30.77 
 
 
283 aa  107  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
269 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.35 
 
 
281 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  30.07 
 
 
274 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  27.27 
 
 
271 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
271 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  28.31 
 
 
268 aa  105  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
271 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  28.99 
 
 
281 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  28.32 
 
 
274 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  28.99 
 
 
281 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  29.1 
 
 
270 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
264 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
279 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  29.26 
 
 
270 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.24 
 
 
262 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  28.27 
 
 
268 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  29.26 
 
 
270 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
279 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  25.27 
 
 
268 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  31.05 
 
 
270 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 
279 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 
286 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  24.22 
 
 
281 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 
271 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  28.68 
 
 
267 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.96 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  29.5 
 
 
262 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  28.52 
 
 
270 aa  99  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  25.99 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  24.72 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  27.62 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0834  HAD superfamily hydrolase  29.67 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  30.23 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  27.02 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  25.61 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  25.72 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
277 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  27.01 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  26.87 
 
 
271 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  28.36 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  25.56 
 
 
244 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.32 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.42 
 
 
257 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  28.08 
 
 
265 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  29.43 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  26.81 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  23.33 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  29.6 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  25.09 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  30.53 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  26.22 
 
 
244 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>