More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0555 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  100 
 
 		 1218 aa  2499    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  75.64 
 
 		 1217 aa  1915    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  35.62 
 
 		 1241 aa  719    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  35.67 
 
 		 1241 aa  717    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  35.83 
 
 		 1241 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  35.99 
 
 		 1241 aa  721    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  35.75 
 
 		 1241 aa  716    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  35.49 
 
 		 1242 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  75.64 
 
 		 1217 aa  1915    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  35.83 
 
 		 1241 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  36.2 
 
 		 1242 aa  744    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  35.68 
 
 		 1241 aa  717    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  35.86 
 
 		 1240 aa  724    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  36.23 
 
 		 1241 aa  726    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  35.53 
 
 		 1241 aa  716    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  35.9 
 
 		 1244 aa  717    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  32.6 
 
 		 1251 aa  622  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  33.13 
 
 		 1271 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  33.02 
 
 		 1270 aa  611  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  31.72 
 
 		 1230 aa  606  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  32.22 
 
 		 1248 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  31.77 
 
 		 1244 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  33.28 
 
 		 1233 aa  588  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  30.61 
 
 		 1392 aa  566  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  30.49 
 
 		 1377 aa  556  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  30.6 
 
 		 1282 aa  552  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  30.47 
 
 		 1236 aa  549  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.11 
 
 		 1186 aa  475  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  29.98 
 
 		 1204 aa  468  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.79 
 
 		 1230 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.86 
 
 		 1203 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.76 
 
 		 1405 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  29.55 
 
 		 1217 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 1121 aa  393  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  30.72 
 
 		 1392 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 1240 aa  363  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  30.09 
 
 		 1207 aa  332  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1057 aa  185  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  23.45 
 
 		 1226 aa  169  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 1080 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 1123 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  28.44 
 
 		 1184 aa  159  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 1173 aa  159  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.42 
 
 		 1139 aa  156  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 		 1061 aa  155  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 1149 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 		 1185 aa  150  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.39 
 
 		 1262 aa  144  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  23.09 
 
 		 1161 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.28 
 
 		 1240 aa  142  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  22.46 
 
 		 1124 aa  142  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  23.34 
 
 		 1147 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.62 
 
 		 1209 aa  140  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.48 
 
 		 1269 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.09 
 
 		 772 aa  138  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 1130 aa  137  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  25.61 
 
 		 727 aa  135  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  26.86 
 
 		 727 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 1115 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4851  exodeoxyribonuclease V beta chain  21.79 
 
 		 1244 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.52 
 
 		 1242 aa  132  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.73 
 
 		 678 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.72 
 
 		 1251 aa  132  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 		 1047 aa  131  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.44 
 
 		 1119 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  24.91 
 
 		 720 aa  130  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.9 
 
 		 1226 aa  130  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  23.91 
 
 		 1164 aa  129  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  25.54 
 
 		 728 aa  129  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  21.38 
 
 		 1125 aa  129  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  23 
 
 		 1165 aa  129  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 1065 aa  129  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  24.55 
 
 		 723 aa  129  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55670  exodeoxyribonuclease V beta chain  23.28 
 
 		 1245 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.80629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  21.86 
 
 		 1180 aa  129  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 1131 aa  128  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  25.15 
 
 		 728 aa  128  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.58 
 
 		 1089 aa  128  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 1107 aa  127  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  22.26 
 
 		 1180 aa  127  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  25.14 
 
 		 727 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3232  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.19 
 
 		 1240 aa  127  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0067022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 1161 aa  127  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  24.34 
 
 		 1110 aa  126  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.33 
 
 		 725 aa  127  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  24.92 
 
 		 1110 aa  125  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.5 
 
 		 1183 aa  125  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.24 
 
 		 781 aa  125  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  25.62 
 
 		 1117 aa  124  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  24.92 
 
 		 1110 aa  124  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  24.95 
 
 		 727 aa  124  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  23.18 
 
 		 739 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  25.39 
 
 		 728 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 		 1196 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  24.86 
 
 		 665 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.28 
 
 		 776 aa  124  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  24.81 
 
 		 728 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.39 
 
 		 797 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.6 
 
 		 773 aa  123  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  25.1 
 
 		 729 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>