70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0481 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0828  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 238 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0845  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 238 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.403123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  34.3 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  32.24 
 
 		 252 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  32.24 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  32.24 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  32.24 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  32.24 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  33.17 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  30.37 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  29.91 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  30.23 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  30.37 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  30.23 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  30.37 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  30.37 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.23 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  30.37 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  31.28 
 
 		 253 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.63 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.14 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  32.76 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.64 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  30.53 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1379  3-dehydroquinate dehydratase  32.06 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0591105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0688  3-dehydroquinate dehydratase  29.7 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1391  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.44 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2355  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.25 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.1738899999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2381  3-dehydroquinate dehydratase  26.57 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  29.38 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  28.64 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1160  3-dehydroquinate dehydratase  28.57 
 
 		 293 aa  85.9  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26294  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1805  3-dehydroquinate dehydratase  31.84 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000149393  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  23.85 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.78 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  26.7 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  29.69 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.69 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  29.11 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15040  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.93 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0198448  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.86 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  29.86 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  27.39 
 
 		 526 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.02 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.23 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  25.35 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.25 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.32 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  28.04 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  28.08 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.065136 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  25.82 
 
 		 517 aa  68.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  28 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  23.81 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  27.36 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  29.41 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2722  3-dehydroquinate dehydratase  30.17 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.92 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.45 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  24.3 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  25.35 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1285  3-dehydroquinate dehydratase, putative (AroD)  27.93 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  27.41 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1652  hypothetical protein  32.26 
 
 		 473 aa  52.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00124545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  24.17 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  23.79 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4110  3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase  28.41 
 
 		 613 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471518  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1870  3-dehydroquinate dehydratase  22.86 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.438202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  21.33 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  24.49 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>