More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0465 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  100 
 
 		 313 aa  626  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  68.93 
 
 		 319 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  68.93 
 
 		 319 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 		 316 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1433  cation diffusion facilitator family transporter  53.74 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  51.38 
 
 		 317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.68 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.68 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  41.42 
 
 		 325 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  40.89 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.37 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  36.04 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.4 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.4 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  38.02 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.4 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  40.74 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  38.02 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.4 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  42.22 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 378 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.97 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.09 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 326 aa  195  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  34.82 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  35.31 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  40.48 
 
 		 298 aa  192  9e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  35.93 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  34.68 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  35.93 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.27 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.78 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.87 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  37.87 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  38.24 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  38.55 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  38.55 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  38.55 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  35.86 
 
 		 312 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  38.55 
 
 		 312 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  38.55 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  36.17 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  36.17 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  37.33 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 		 347 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.09 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  33.67 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  35.28 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  35.06 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  35.16 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.16 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  33.76 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 359 aa  175  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  35.97 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  34.63 
 
 		 342 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  40.15 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  40.15 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  40.15 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  40.15 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.94 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  40.15 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.94 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  39.78 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  34.69 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0020  cation efflux family protein  36.07 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>