More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0446 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
434 aa  882    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  94.24 
 
 
434 aa  840    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  74.77 
 
 
431 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  78.95 
 
 
435 aa  696    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 
431 aa  651    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 
431 aa  651    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 
431 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  94.24 
 
 
434 aa  840    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 
431 aa  636    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 
431 aa  651    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  74.77 
 
 
431 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 
431 aa  651    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  74.77 
 
 
431 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  74.08 
 
 
430 aa  644    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  74.31 
 
 
430 aa  645    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 
430 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  78.62 
 
 
433 aa  687    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  80.28 
 
 
434 aa  701    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 
431 aa  651    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 
431 aa  628  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  68.52 
 
 
428 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  69.04 
 
 
431 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  67.37 
 
 
428 aa  599  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 
430 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1824  phosphopyruvate hydratase  70.24 
 
 
425 aa  595  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  67.36 
 
 
427 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.67 
 
 
429 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.82 
 
 
431 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  68.6 
 
 
430 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.44 
 
 
429 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  66.13 
 
 
432 aa  588  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
429 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
429 aa  586  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  67.43 
 
 
435 aa  584  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.59 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  68.09 
 
 
427 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 
429 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.44 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 
428 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.13 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.6 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 
428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  65.29 
 
 
432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 
427 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
428 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.67 
 
 
429 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 
433 aa  570  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  64.58 
 
 
427 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.67 
 
 
428 aa  565  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 
429 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.05 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 
428 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
429 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.45 
 
 
433 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
427 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65.83 
 
 
430 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 
427 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.81 
 
 
427 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
428 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0240  phosphopyruvate hydratase  65.74 
 
 
441 aa  558  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.8527  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
428 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 
429 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  64.65 
 
 
427 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  63.82 
 
 
428 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
425 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 
429 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2706  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
428 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
425 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  62.7 
 
 
425 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 
427 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  63.97 
 
 
429 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 
425 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  62.96 
 
 
427 aa  548  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 
429 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  63.87 
 
 
428 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
427 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  64.12 
 
 
427 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 
429 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 
427 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 
433 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 
427 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
425 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  62.59 
 
 
427 aa  548  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  60.84 
 
 
425 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1650  enolase  63.93 
 
 
448 aa  550  1e-155  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
427 aa  544  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 
426 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>