239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0445 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 505 aa  1037    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  61.61 
 
 		 509 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  61.61 
 
 		 509 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  61.61 
 
 		 509 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  61.61 
 
 		 509 aa  646    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  62.01 
 
 		 509 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  61.61 
 
 		 509 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  61.81 
 
 		 509 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  89.11 
 
 		 505 aa  941    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  61.81 
 
 		 509 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  61.76 
 
 		 511 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  61.57 
 
 		 512 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  61.61 
 
 		 509 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  61.81 
 
 		 509 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  61.61 
 
 		 509 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  89.11 
 
 		 505 aa  941    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  53.85 
 
 		 512 aa  568  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  56.27 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  54.31 
 
 		 512 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  53.31 
 
 		 512 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  53.11 
 
 		 512 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 		 514 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 509 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 517 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  51.77 
 
 		 509 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  52.35 
 
 		 513 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 512 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 		 514 aa  521  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  50.99 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 518 aa  519  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  48.43 
 
 		 513 aa  512  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.87 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 532 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  52.38 
 
 		 511 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  51.68 
 
 		 510 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  51.39 
 
 		 529 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  51.28 
 
 		 514 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  52.18 
 
 		 511 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 532 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  51.09 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 516 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 512 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  51.39 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  48.74 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  48.45 
 
 		 542 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  49.04 
 
 		 525 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  51.79 
 
 		 511 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  51.36 
 
 		 517 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  47.66 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 		 515 aa  499  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 		 542 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  49.12 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  47.49 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 510 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 514 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 514 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  46.84 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  49.7 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 514 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 514 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 		 520 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  48.74 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  49.7 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  48.5 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  48.43 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 513 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  47.63 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  47.16 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  47.92 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  47.36 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  49.11 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  47.47 
 
 		 523 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>