More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0443 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 396 aa  786    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  87.88 
 
 		 396 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  87.88 
 
 		 396 aa  702    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  70.93 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  64.09 
 
 		 407 aa  525  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0248  phosphoglycerate kinase  62.56 
 
 		 398 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  63.86 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1755  phosphoglycerate kinase  63.66 
 
 		 399 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.542191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1766  phosphoglycerate kinase  64.07 
 
 		 398 aa  491  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  62.81 
 
 		 405 aa  488  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  62.22 
 
 		 404 aa  487  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl577  phosphoglycerate kinase  60.85 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0631  phosphoglycerate kinase  60.1 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0347662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  58.21 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  58.46 
 
 		 399 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  59 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  56.22 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  56.47 
 
 		 655 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  55.22 
 
 		 400 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  53.79 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  54.39 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  55.11 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  54.86 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  53.23 
 
 		 396 aa  411  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  54.95 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.85 
 
 		 650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  54.02 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  52.75 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  51.63 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  51.88 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  51.63 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  51.38 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  51.38 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  51.38 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  48.23 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  50.37 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  50.49 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  49.63 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  51.71 
 
 		 403 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  51.13 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  51.49 
 
 		 399 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  48.14 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  48.25 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  48.4 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  48.5 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  48.21 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 		 395 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  47.46 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  48.13 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  48.76 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15210  phosphoglycerate kinase  47.62 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00329101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  47.65 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  45.11 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  47.9 
 
 		 401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  46.35 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.67 
 
 		 402 aa  356  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  47.63 
 
 		 435 aa  355  5.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  47.86 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  46.39 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  47.04 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  46.13 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  47.04 
 
 		 402 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 		 397 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  46.13 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  47.03 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2016  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  45.89 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  46.8 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3009  Phosphoglycerate kinase  47.72 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0329661 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  46.55 
 
 		 402 aa  348  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  47.5 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  46.12 
 
 		 396 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  47.92 
 
 		 406 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1715  phosphoglycerate kinase  47 
 
 		 419 aa  345  8e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  47.39 
 
 		 401 aa  345  8e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 687 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>