298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0390 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0390  bmrU protein  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0749  diacylglycerol kinase, catalytic region  71.05 
 
 
305 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.868968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0766  diacylglycerol kinase catalytic region  71.05 
 
 
305 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  30.03 
 
 
300 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  30.03 
 
 
301 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  30.14 
 
 
300 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  29.79 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  29.79 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  29.79 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  30.03 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  29.69 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  30.14 
 
 
300 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  29.79 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  29.79 
 
 
300 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  27.52 
 
 
291 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  28.93 
 
 
304 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  27.2 
 
 
302 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  27.2 
 
 
302 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.4 
 
 
312 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  28.51 
 
 
311 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  26.17 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1900  diacylglycerol kinase family lipid kinase  25.65 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0696483  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  25.19 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  26.94 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  26.33 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  26.78 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  26.94 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  26.78 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  24.83 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  25.98 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  25.82 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  24.65 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  26.17 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  29.36 
 
 
310 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  24.48 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  24.8 
 
 
308 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.24 
 
 
297 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  22.85 
 
 
301 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  25.79 
 
 
317 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  22.52 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  25.63 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  24.32 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  24.32 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  24.24 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  26.34 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  29.54 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  29.54 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  24.82 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  24.46 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  27.62 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  26.02 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  22.81 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  24.42 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  26.4 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  21.62 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  25.79 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  25.1 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0393  diacylglycerol kinase, catalytic region  24.16 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0393706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  27.92 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1398  diacylglycerol kinase catalytic region  27.2 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175601  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0414  hypothetical protein  22.97 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  25.19 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  24.8 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  26.56 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  23.63 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  25.62 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  24.51 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  24.12 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  24.03 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_357  hypothetical protein  22.64 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445799  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  24.38 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  24.6 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  24.39 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1118  diacylglycerol kinase, catalytic region  24.6 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.867073  decreased coverage  0.00200137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  26.82 
 
 
547 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  24.57 
 
 
545 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0633  diacylglycerol kinase catalytic region  28.69 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000157302  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  24.58 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  26.67 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  22.22 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  25.93 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  25.09 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11690  conserved protein of unknown function BmrU  25.2 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  22.44 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  24.58 
 
 
563 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  24.03 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3667  putative lipid kinase  24.89 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3510  putative lipid kinase  24.44 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  23.76 
 
 
568 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  22.3 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0869  diacylglycerol kinase catalytic region  27.13 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>