153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0382 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  57.78 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  59.12 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  58.96 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  58.39 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  58.97 
 
 		 272 aa  294  8e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  56.04 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  54.04 
 
 		 270 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  56.99 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  55.13 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  55.51 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  53.53 
 
 		 269 aa  274  9e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  51.84 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  53.61 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  52.09 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  55.19 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  52.22 
 
 		 268 aa  254  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  57.89 
 
 		 267 aa  251  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  52.21 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  51.97 
 
 		 258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  46.62 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  46.32 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  47.64 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  46.64 
 
 		 277 aa  215  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  42.8 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  40.58 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  40.89 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  40.07 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  40.61 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  39.27 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  41.48 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  39.29 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  39.29 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  38.28 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  37 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  36.15 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  38.02 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  40.32 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  36.84 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  39.16 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  39.16 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  36.47 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  32.61 
 
 		 304 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  42.86 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  36.09 
 
 		 297 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  37.25 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  36.09 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  37 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  39.76 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  36.19 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  36.98 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  35.77 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  38.43 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  36.6 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  37.26 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  39.11 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  36.67 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  37.5 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  36.64 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  36.74 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  33.73 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  35.57 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  37.08 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  37.5 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  30.39 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  33.47 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  32.16 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  33.2 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  32.43 
 
 		 258 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  31.71 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  30.15 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  31.43 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  30.71 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  28.75 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  34.1 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  29.23 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  30.92 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  28.28 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  35.4 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  29.51 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  28.37 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  31.25 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  30 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  31.03 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  34 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  29.2 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  29.03 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  32.27 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  28.41 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  30.48 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  29.57 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  28.2 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  29.71 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  28.63 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  29.71 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  30.08 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.08 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  30.04 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  30.23 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  32.43 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>