286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0378 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0378  urea amidolyase-related protein  100 
 
 		 334 aa  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0741  hypothetical protein  78.14 
 
 		 334 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0758  hypothetical protein  78.14 
 
 		 334 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  31.82 
 
 		 348 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  31.82 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0477  allophanate hydrolase, subunit 2  33.43 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  32.72 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0373  urea amidolyase related protein  31.8 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.550706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0088  allophanate hydrolase subunit 2  32.52 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.419671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0022  Urea carboxylase  33.97 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  31.91 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  32.8 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1146  urea amidolyase related protein  31.42 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.234826  normal  0.390267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  30.79 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  30.98 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  32.8 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0177  urea amidolyase related protein  30.67 
 
 		 389 aa  162  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1738  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  31.89 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3310  allophanate hydrolase, subunit 2  32.26 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4360  allophanate hydrolase subunit 2  32.6 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0265  allophanate hydrolase, subunit 2  32.26 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0143689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2112  allophanate hydrolase, subunit 2  32.26 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0253  allophanate hydrolase, subunit 2  32.26 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3368  allophanate hydrolase, subunit 2  32.26 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2980  allophanate hydrolase, subunit 2  32.26 
 
 		 371 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.409998  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000164  allophanate hydrolase subunit 2  33.44 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.732807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2848  urea amidolyase-like protein  32.01 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.68 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0448  urea amidolyase-like protein  32.15 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2061  urea amidolyase related protein  34.47 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.180857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3119  urea amidolyase-related protein  31.68 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000401066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3101  urea amidolyase-related protein  31.68 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2149  urea amidolyase-related protein  32.2 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3033  urea amidolyase related protein  32.27 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.74353 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05797  allophanate hydrolase, subunit 2  32.89 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  31.64 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2881  urea amidolyase-related protein  31.85 
 
 		 320 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3096  urea amidolyase-related protein  31.85 
 
 		 320 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.379223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0229  urea amidolyase-related protein  32.26 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  31.34 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0010  urea amidolyase related protein  31.66 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0117619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2424  allophanate hydrolase subunit 2  30.7 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0010  urea amidolyase related protein  31.66 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  30.58 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3038  urea amidolyase related protein  30.7 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3057  urea amidolyase related protein  30.7 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.027939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1215  urea amidolyase related protein  32.11 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.478811  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3087  urea amidolyase-related protein  31.61 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0010  urea amidolyase related protein  31.35 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3120  urea amidolyase-related protein  31.15 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0006  urea amidolyase related protein  31.35 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0737  allophanate hydrolase, subunit 2  31.33 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3449  putative allophanate hydrolase subunit 2  30.89 
 
 		 354 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3094  urea amidolyase related protein  30.58 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604778  normal  0.778308 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1171  urea amidolyase-related protein  31.69 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  30.75 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2048  urea amidolyase related protein  30 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  0.316716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1137  urea amidolyase related protein  33.13 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0629  allophanate hydrolase, subunit 2  31.01 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  30.61 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0802  allophanate hydrolase, subunit 2  30.38 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.316983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0727  allophanate hydrolase, subunit 2  30.38 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25799  normal  0.390135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0821  allophanate hydrolase, subunit 2  29.19 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0263857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0836  allophanate hydrolase subunit 2  29.19 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  hitchhiker  0.00120762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0760  allophanate hydrolase, subunit 2  29.19 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0870  allophanate hydrolase subunit 2  29.19 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00672  predicted enzyme subunit  30.7 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2924  urea amidolyase related protein  30.7 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.126507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2943  urea amidolyase related protein  30.7 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0773  allophanate hydrolase subunit 2  29.19 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.905688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00661  hypothetical protein  30.7 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0760  allophanate hydrolase, subunit 2  30.7 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1665  hypothetical protein  30.55 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1699  hypothetical protein  30.55 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1827  urea amidolyase related protein  30.19 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4042  urea amidolyase related protein  29.27 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1271  urea amidolyase related protein  32.54 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0359  urea amidolyase related protein  31.37 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0883531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2949  urea amidolyase related protein  30.61 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  0.639437 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0718  hypothetical protein  29.28 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6385  allophanate hydrolase subunit 2  29.91 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3083  urea amidolyase related protein  30.61 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3380  urea amidolyase related protein  29.35 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.709139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3109  urea amidolyase related protein  31.37 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1438  putative allophanate hydrolase subunit 2  31.95 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1902  hypothetical protein  31.94 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2789  urea amidolyase related protein  30.84 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01990  biotin-dependent carboxylase-like protein  31.07 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.564153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3549  urea amidolyase related protein  29.58 
 
 		 315 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1227  urea amidolyase related protein  31.99 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  31.09 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  31.37 
 
 		 549 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4133  putative carboxylase, like RuBisCO, small subunit  27.3 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1714  hypothetical protein  30.65 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.768443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1116  biotin-dependent carboxylase domain-containing protein  29.5 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000309284  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2826  urea amidolyase related protein  28.66 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196428  hitchhiker  0.00928055 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1528  hypothetical protein  30.52 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1168  urea amidolyase related protein  29.5 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000170574  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1099  allophanate hydrolase subunit 2  30.41 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.154385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>