More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0358 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  81.05 
 
 		 306 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  81.05 
 
 		 306 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  46.84 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  46.84 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  47.18 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  47.18 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  46.84 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  46.51 
 
 		 303 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  46.18 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  46.18 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  46.18 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  47.33 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  46.53 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  45.87 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  45.67 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  42.67 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 		 305 aa  252  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  41.5 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  41.72 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  41.16 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  42.52 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  40.33 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  40.4 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  36.82 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  37.21 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  37.91 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  35.81 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  34.59 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.82 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.31 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  34.43 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  33.33 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  33.33 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  34.67 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  34.84 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  34.41 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  32.14 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.33 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.38 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  35.29 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  32.13 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  33.97 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  31.2 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  29.58 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  30.32 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  34.02 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  34.02 
 
 		 310 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  35.05 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  35.05 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  30.99 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.58 
 
 		 308 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  33.71 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.68 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.66 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  34.22 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  33.84 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  31.14 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  28.57 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  34.22 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  30.77 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  30.19 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  30.66 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  32.62 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  31.52 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2661  1-phosphofructokinase  35.46 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  32.62 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  30 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  30.47 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>