More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0334 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  66.85 
 
 
180 aa  254  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  66.85 
 
 
180 aa  254  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
189 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 
187 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
189 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  40.23 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  40.46 
 
 
185 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  40.11 
 
 
181 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 
195 aa  131  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  40.8 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  37.93 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  40.11 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  38.86 
 
 
182 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  38.29 
 
 
182 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  39.55 
 
 
189 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  37.64 
 
 
194 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  38.73 
 
 
186 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  38.98 
 
 
190 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  39.55 
 
 
189 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  37.85 
 
 
189 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  41.04 
 
 
186 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
190 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  38.55 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  37.79 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  38.51 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  37.79 
 
 
196 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  40.12 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  34.29 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  36.47 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 
318 aa  111  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  38.25 
 
 
192 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
183 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
204 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
177 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
296 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
170 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
188 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  34.09 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
189 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
188 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
285 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  36.76 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  33.75 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.03 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.61 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0983  hypothetical protein  32.5 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  29.31 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.911008  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0903  putative acetyltransferase  27.33 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1789  GCN5-related protein N-acetyltransferase  28 
 
 
191 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  0.254544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>