128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0323 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0323  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  332  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.683265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0694  hypothetical protein  62.42 
 
 
157 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0709  hypothetical protein  62.42 
 
 
157 aa  207  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.353114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3190  hypothetical protein  52.83 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3487  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706837  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0636  hypothetical protein  49.36 
 
 
160 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00429491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3241  hypothetical protein  51.27 
 
 
161 aa  163  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0799  hypothetical protein  48.08 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3596  protein of unknown function DUF985  50.64 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0646  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3662  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3785  hypothetical protein  50.64 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3317  hypothetical protein  49.36 
 
 
160 aa  160  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3192  hypothetical protein  49.07 
 
 
159 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3916  hypothetical protein  48.7 
 
 
162 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1672  hypothetical protein  45.24 
 
 
167 aa  153  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000193822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1883  hypothetical protein  44.72 
 
 
164 aa  148  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3029  hypothetical protein  46.45 
 
 
156 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.111246  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2172  hypothetical protein  44.1 
 
 
164 aa  147  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.556394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2202  protein of unknown function DUF985  39.51 
 
 
171 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2358  protein of unknown function DUF985  42.5 
 
 
173 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0879  protein of unknown function DUF985  41.1 
 
 
168 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1899  hypothetical protein  39.1 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3937  protein of unknown function DUF985  40.61 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6946  hypothetical protein  40.91 
 
 
174 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1054  hypothetical protein  37.65 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3205  hypothetical protein  39.75 
 
 
170 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0323  hypothetical protein  35.76 
 
 
166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0173  hypothetical protein  41.36 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5607  protein of unknown function DUF985  38.04 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0462  hypothetical protein  37.58 
 
 
166 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4717  hypothetical protein  39.24 
 
 
193 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0738  protein of unknown function DUF985  35.76 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2146  protein of unknown function DUF985  40.91 
 
 
157 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000712763  decreased coverage  0.00382026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1954  protein of unknown function DUF985  37.72 
 
 
168 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000157588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0287  hypothetical protein  36.57 
 
 
176 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1589  hypothetical protein  33.94 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1284  hypothetical protein  37.27 
 
 
170 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4627  protein of unknown function DUF985  37.89 
 
 
172 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0728086  normal  0.0128085 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4495  protein of unknown function DUF985  37.89 
 
 
172 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0206455  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2769  hypothetical protein  37.74 
 
 
191 aa  117  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2335  protein of unknown function DUF985  39.75 
 
 
195 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0507  hypothetical protein  43.17 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0225677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0068  hypothetical protein  41.55 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0092  hypothetical protein  42.14 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.965626  normal  0.113138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0553  hypothetical protein  37.27 
 
 
180 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1581  hypothetical protein  37.35 
 
 
164 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.254567  normal  0.0129859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3403  protein of unknown function DUF985  36.65 
 
 
172 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0656  protein of unknown function DUF985  36.31 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2608  hypothetical protein  35.67 
 
 
170 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0596  protein of unknown function DUF985  35.29 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.698385  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0372  hypothetical protein  45.19 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.671361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1157  hypothetical protein  41.01 
 
 
140 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2490  hypothetical protein  41.01 
 
 
140 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0065112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0612  hypothetical protein  34.13 
 
 
168 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2553  hypothetical protein  41.3 
 
 
154 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01699  hypothetical protein  36.65 
 
 
172 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2832  hypothetical protein  34.67 
 
 
171 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.254743  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3999  hypothetical protein  35.4 
 
 
168 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4368  hypothetical protein  35.4 
 
 
168 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1550  hypothetical protein  37.42 
 
 
174 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13534  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3777  hypothetical protein  36.65 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489554  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5986  hypothetical protein  35.4 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4251  hypothetical protein  36.65 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408223  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1897  protein of unknown function DUF985  41.35 
 
 
155 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1833  hypothetical protein  37.59 
 
 
145 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0854594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0465  hypothetical protein  43.28 
 
 
136 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4253  hypothetical protein  35.4 
 
 
168 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180495  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2020  hypothetical protein  36.67 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345006  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0027  cupin superfamily protein  36.25 
 
 
203 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1577  hypothetical protein  40.15 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.925208  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0377  hypothetical protein  39.1 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0429  hypothetical protein  40.6 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1649  hypothetical protein  34.78 
 
 
168 aa  97.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.218017  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0449  protein of unknown function DUF985  38.13 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5124  hypothetical protein  39.29 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660127  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0898  protein of unknown function DUF985  33.73 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000178921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4997  protein of unknown function DUF985  38.85 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2382  hypothetical protein  36.76 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.377093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2062  hypothetical protein  37.41 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4537  hypothetical protein  39.13 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5050  protein of unknown function DUF985  38.85 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4037  hypothetical protein  38.13 
 
 
143 aa  94.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0615  protein of unknown function DUF985  42.06 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199543  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  32.72 
 
 
575 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3282  hypothetical protein  36.03 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3876  protein of unknown function DUF985  38.24 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2733  hypothetical protein  31.33 
 
 
171 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0654551  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2149  putative cupin  36.73 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.928679 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8503  predicted protein  38.93 
 
 
130 aa  90.5  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1205  hypothetical protein  37.06 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3583  protein of unknown function DUF985  38.35 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0454  protein of unknown function DUF985  36.92 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0664  hypothetical protein  32.68 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2689  hypothetical protein  34.07 
 
 
271 aa  85.5  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1992  hypothetical protein  30.61 
 
 
184 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174159  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2957  hypothetical protein  28.75 
 
 
171 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1803  hypothetical protein  34.72 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.875954  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3266  hypothetical protein  31.88 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.422669  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7610  hypothetical protein  37.61 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139657  normal  0.0983824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>