135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0276 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  65.32 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  65.32 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  36.25 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  33.66 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  33.56 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  36.96 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  36.09 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  37.93 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  34.46 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  35.56 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  32.24 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  35.37 
 
 		 146 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  32.84 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  24.26 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  36.21 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  32.43 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  33.78 
 
 		 145 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  24.91 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  33.9 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  31.53 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  29.1 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  33.81 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  33.07 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.52 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  31.85 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  28.26 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  30.88 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  31.11 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  31.34 
 
 		 148 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  30.15 
 
 		 147 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  27.48 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  24.2 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  34.17 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  30.15 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  31.54 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  30.15 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  26.92 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  30.08 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  29.71 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  26.9 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  25.17 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  30.15 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  31.62 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  33.83 
 
 		 148 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  26.15 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  27.82 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  28.38 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  29.29 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  29.17 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  31.9 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  28.69 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  32.54 
 
 		 151 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  33.12 
 
 		 147 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  25.56 
 
 		 154 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 144 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  31.97 
 
 		 140 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  32.06 
 
 		 142 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  28.68 
 
 		 151 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  32.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  23.08 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  23.08 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  23.08 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  23.08 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  23.08 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  40.51 
 
 		 143 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  26.54 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  22.26 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  30.87 
 
 		 147 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  25.19 
 
 		 163 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  32.88 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  32.88 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  32.71 
 
 		 160 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  32.88 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  28.06 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  32.88 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  32.17 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  31.72 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  31.72 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  31.72 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  30.2 
 
 		 147 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  28.9 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  25.87 
 
 		 183 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  27.48 
 
 		 148 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  27.48 
 
 		 148 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  25.78 
 
 		 163 aa  49.3  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>