38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0185 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0581  putative ribosomal protein L7Ae-like  84.34 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00254265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0567  putative ribosomal protein L7Ae-like  84.34 
 
 		 84 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000530013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  37.35 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  38.55 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5201  hypothetical protein  40.48 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000267841  unclonable  7.36265e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0099  hypothetical protein  40.48 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0098  hypothetical protein  39.29 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0104  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0116  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.74724e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0104  hypothetical protein  39.29 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000573275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0104  hypothetical protein  39.29 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000288714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0125  hypothetical protein  36.9 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0135  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0100  hypothetical protein  39.29 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000444841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  32.84 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0416  ribosomal protein L7AE family protein  40 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000181498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0098  hypothetical protein  38.1 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000338227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  34.29 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  40.28 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  33.33 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  30 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  30.56 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  30.88 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  27.71 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  36.23 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  29.41 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  31.94 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0963  50S ribosomal protein L7Ae  31.03 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1665  50S ribosomal protein L7Ae  31.03 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0339872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0248  50S ribosomal protein L7Ae  31.03 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.182406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  28.17 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2621  50S ribosomal protein L7Ae  26.09 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302096  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1553  50S ribosomal protein L7Ae  28.74 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.751058  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  31.88 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  26.09 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  30.77 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>