More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0168 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 491 aa  666    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 484 aa  999    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 485 aa  666    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 485 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 485 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 485 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  89.19 
 
 		 484 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 485 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 		 486 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  89.19 
 
 		 484 aa  884    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 485 aa  666    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 		 485 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  67.77 
 
 		 491 aa  670    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 		 485 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  67.56 
 
 		 491 aa  676    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 491 aa  628  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 484 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 499 aa  550  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 484 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 483 aa  538  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 485 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 485 aa  482  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 493 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.42 
 
 		 495 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 881 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 481 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 488 aa  362  6e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 466 aa  359  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  38.4 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 487 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 465 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 467 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 474 aa  349  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 465 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 475 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 502 aa  347  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 480 aa  347  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 509 aa  346  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 502 aa  346  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 470 aa  345  8e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 467 aa  345  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 492 aa  345  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  38.49 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>