81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0167 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  100 
 
 
358 aa  717    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  77.56 
 
 
357 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  77.56 
 
 
357 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  40.06 
 
 
364 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  40.62 
 
 
364 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  40.34 
 
 
367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  40.34 
 
 
367 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  39.72 
 
 
370 aa  262  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  40.11 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  40.11 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  40.11 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  40.11 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  40.11 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  39.55 
 
 
369 aa  258  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  35.85 
 
 
363 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  41.67 
 
 
383 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  39.66 
 
 
364 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  37.1 
 
 
368 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  41.39 
 
 
367 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  43.59 
 
 
371 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  36.12 
 
 
388 aa  225  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 
380 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  37.1 
 
 
368 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  38.91 
 
 
383 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  34.64 
 
 
361 aa  216  7e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  40.07 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  35.81 
 
 
367 aa  212  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  37.47 
 
 
360 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  47.33 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  39.26 
 
 
369 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  36.13 
 
 
359 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  39.52 
 
 
384 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  39.18 
 
 
358 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  39.44 
 
 
360 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  39.44 
 
 
360 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  36.28 
 
 
357 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  40.66 
 
 
366 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  38.89 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  39.53 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  38.49 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  39.44 
 
 
346 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  34.44 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  35.25 
 
 
383 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  46.39 
 
 
377 aa  192  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  46.73 
 
 
269 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 
336 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  40.91 
 
 
369 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  39.04 
 
 
346 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  40.45 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  40.45 
 
 
369 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  34.22 
 
 
385 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  36.43 
 
 
361 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  32.79 
 
 
385 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  44.62 
 
 
371 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  32.96 
 
 
369 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  32.69 
 
 
369 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  39.55 
 
 
369 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  36.07 
 
 
364 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  43.3 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  36.36 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  42.11 
 
 
355 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  43.3 
 
 
385 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  38.31 
 
 
344 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  33.44 
 
 
346 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  40.72 
 
 
388 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  48.75 
 
 
168 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  35.74 
 
 
361 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0094  hypothetical protein  29.11 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  30.89 
 
 
633 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  32.85 
 
 
655 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  32.35 
 
 
605 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  28.19 
 
 
633 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  30.08 
 
 
631 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  29.32 
 
 
629 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  27.06 
 
 
625 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  27.68 
 
 
631 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  30.08 
 
 
642 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  27.21 
 
 
602 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  30.89 
 
 
658 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  29.84 
 
 
634 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  28.46 
 
 
671 aa  42.7  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>