127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0159 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0159  glutamine amidotransferase subunit PdxT  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0542  glutamine amidotransferase subunit PdxT  80.98 
 
 
186 aa  308  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0556  glutamine amidotransferase subunit PdxT  80.98 
 
 
186 aa  308  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  64.55 
 
 
192 aa  245  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000128055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.79 
 
 
196 aa  236  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5303  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.79 
 
 
196 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178442  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.26 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000589315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.79 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000439429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.26 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000149279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  61.08 
 
 
196 aa  233  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00056794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.26 
 
 
196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000426828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.04 
 
 
196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0014  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.79 
 
 
196 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.79 
 
 
196 aa  223  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000347383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0012  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.26 
 
 
196 aa  222  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000139131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0015  glutamine amidotransferase subunit PdxT  59.26 
 
 
196 aa  222  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1037  glutamine amidotransferase  57.38 
 
 
191 aa  204  8e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0573  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0013  SNO glutamine amidotransferase  51.09 
 
 
193 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2298  SNO glutamine amidotransferase  45.88 
 
 
211 aa  176  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0008  SNO glutamine amidotransferase  46.03 
 
 
194 aa  174  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5148  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.31 
 
 
203 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00302911  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1367  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.21 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_002936  DET0598  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.34 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.474532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_538  SNO glutamine amidotransferase family  49.47 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0463  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.8 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000714565  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0448  glutamine amidotransferase subunit PdxT  50.26 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000803094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2041  SNO glutamine amidotransferase  47.31 
 
 
190 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0223517  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3058  SNO glutamine amidotransferase  45.31 
 
 
207 aa  170  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.293498  normal  0.634434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2067  SNO glutamine amidotransferase  46.6 
 
 
196 aa  170  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1439  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.45 
 
 
186 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2240  SNO glutamine amidotransferase  47.57 
 
 
189 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0214455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1664  SNO glutamine amidotransferase  43.07 
 
 
213 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0590929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.7 
 
 
189 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000532264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2382  SNO glutamine amidotransferase  45.5 
 
 
201 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2566  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.53 
 
 
195 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1547  SNO glutamine amidotransferase  45.16 
 
 
195 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0627546  hitchhiker  0.00674426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1930  SNO glutamine amidotransferase  43.81 
 
 
201 aa  166  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.41 
 
 
188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200223  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2109  SNO glutamine amidotransferase  44.16 
 
 
204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0561786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2289  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.64 
 
 
206 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2250  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.64 
 
 
206 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2297  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.64 
 
 
206 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0011  glutamine amidotransferase subunit PdxT  47.06 
 
 
188 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1858  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.74 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0468928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6117  SNO glutamine amidotransferase family  44.09 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298038  normal  0.336811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3399  SNO glutamine amidotransferase  46.49 
 
 
203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144938  hitchhiker  0.00000892885 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1897  SNO glutamine amidotransferase  45.9 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0960589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0824  SNO glutamine amidotransferase  44.1 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0589495  normal  0.0695207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2107  SNO glutamine amidotransferase  41.88 
 
 
219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0846545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3180  SNO glutamine amidotransferase  42.56 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2097  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.15 
 
 
201 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1791  SNO glutamine amidotransferase  44.5 
 
 
201 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16453  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1750  glutamine amidotransferase subunit PdxT  46.7 
 
 
191 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1859  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.39 
 
 
189 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00060363  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1988  SNO glutamine amidotransferase  43.94 
 
 
200 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2350  SNO glutamine amidotransferase  43.98 
 
 
204 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1347  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.16 
 
 
207 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.550615 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0078  hypothetical protein  47.83 
 
 
189 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0431149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12623  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.43 
 
 
198 aa  159  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15360  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  41.79 
 
 
212 aa  158  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132239  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1110  SNO glutamine amidotransferase  42.33 
 
 
198 aa  158  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00211024  hitchhiker  0.0000000000000181394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2035  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.64 
 
 
236 aa  157  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0035  SNO glutamine amidotransferase  46.2 
 
 
196 aa  157  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1107  glutamine amidotransferase subunit PdxT  43.62 
 
 
201 aa  156  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00213413  decreased coverage  0.0014311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0920  SNO glutamine amidotransferase  41.62 
 
 
186 aa  156  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1908  SNO glutamine amidotransferase  44.44 
 
 
188 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2305  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.64 
 
 
236 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00618121  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1017  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.02 
 
 
187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.538728  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0956  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.02 
 
 
187 aa  154  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1317  SNO glutamine amidotransferase  43.01 
 
 
204 aa  154  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0522409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2628  SNO glutamine amidotransferase  41.97 
 
 
210 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556247  normal  0.566633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1778  SNO glutamine amidotransferase  43.68 
 
 
201 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2184  SNO glutamine amidotransferase  45.79 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000861553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3580  glutamine amidotransferase subunit PdxT  44.22 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.118248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0040  SNO glutamine amidotransferase  41.85 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3830  glutamine amidotransferase subunit PdxT  39.47 
 
 
195 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1792  SNO glutamine amidotransferase  42.78 
 
 
203 aa  150  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.369392  normal  0.171036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2323  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.27 
 
 
196 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0010  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.94 
 
 
192 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1871  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.65 
 
 
192 aa  148  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156111  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1753  glutamine amidotransferase subunit PdxT  42.39 
 
 
187 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.49529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0928  glutamine amidotransferase subunit PdxT  41.85 
 
 
187 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1478  SNO glutamine amidotransferase  42.05 
 
 
205 aa  147  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1483  SNO glutamine amidotransferase  44.39 
 
 
190 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.441099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0551  glutamine amidotransferase subunit PdxT  45.65 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3807  SNO glutamine amidotransferase  43.92 
 
 
190 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00155051  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0468  SNO glutamine amidotransferase  45.31 
 
 
192 aa  144  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0959  SNO glutamine amidotransferase  46.81 
 
 
192 aa  144  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2937  SNO glutamine amidotransferase  40.74 
 
 
190 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0527364  normal  0.214935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1565  SNO glutamine amidotransferase  43.32 
 
 
206 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.499168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0422  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.82 
 
 
198 aa  141  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3161  SNO glutamine amidotransferase  41.3 
 
 
191 aa  141  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655935  normal  0.065831 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19920  pyridoxal phosphate synthase yaaE subunit  38.54 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.573466  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  42.62 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3479  glutamine amidotransferase subunit PdxT  40.11 
 
 
195 aa  136  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.31232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3723  SNO glutamine amidotransferase  36.7 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2227  glutamine amidotransferase subunit PdxT  38.5 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0367546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3235  SNO glutamine amidotransferase  37.43 
 
 
189 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>