41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0132 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0132  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  181  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0528  hypothetical protein  93.1 
 
 
87 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0456568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0515  hypothetical protein  93.1 
 
 
87 aa  174  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000247738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0039  protein of unknown function DUF1021  58.02 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0037  protein of unknown function DUF1021  56.79 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0038  hypothetical protein  57.83 
 
 
103 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0052  veg protein  55.29 
 
 
86 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5268  veg protein  55.29 
 
 
86 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.868803  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0048  veg protein  55.29 
 
 
86 aa  103  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.503705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0041  veg protein  54.12 
 
 
86 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0048  veg protein  54.12 
 
 
86 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0042  veg protein  54.12 
 
 
86 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0039  veg protein  54.12 
 
 
86 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0039  veg protein  54.12 
 
 
86 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0041  veg protein  54.12 
 
 
86 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0038  hypothetical protein  54.22 
 
 
87 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1612  hypothetical protein  51.9 
 
 
81 aa  97.4  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0209  hypothetical protein  52.56 
 
 
79 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000139685  normal  0.0119119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0170  protein of unknown function DUF1021  63.24 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1548  hypothetical protein  51.19 
 
 
84 aa  94.4  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0214  hypothetical protein  42.31 
 
 
80 aa  84  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.615311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0597  hypothetical protein  50.62 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2401  hypothetical protein  45.98 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.273851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0055  hypothetical protein  50.68 
 
 
92 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000091606  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21690  hypothetical protein  45.68 
 
 
86 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.484922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0048  protein of unknown function DUF1021  41.57 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0057  hypothetical protein  43.06 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000870517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2480  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2190  hypothetical protein  46.38 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0020  protein of unknown function DUF1021  41.46 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0403  protein of unknown function DUF1021  41.1 
 
 
78 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0277649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2656  hypothetical protein  39.71 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.214859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04930  hypothetical protein  39.71 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0168  protein of unknown function DUF1021  48.28 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.114258  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07490  hypothetical protein  39.71 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.635673  normal  0.494829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3814  hypothetical protein  32.43 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000228134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2403  protein of unknown function DUF1021  33.33 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1974  hypothetical protein  39.47 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344944  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0770  hypothetical protein  31.94 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.119581  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2138  hypothetical protein  36.59 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0791  hypothetical protein  30.56 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>