More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0131 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  100 
 
 
296 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  84.8 
 
 
297 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  84.8 
 
 
297 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  60.64 
 
 
293 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  358  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  59.43 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  59.79 
 
 
292 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  59.79 
 
 
291 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  54.12 
 
 
290 aa  312  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  51.93 
 
 
290 aa  304  9.000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  52.92 
 
 
294 aa  300  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  48.04 
 
 
295 aa  278  6e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  47.46 
 
 
293 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  47.89 
 
 
288 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  46.1 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  46.24 
 
 
292 aa  251  7e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  44.03 
 
 
305 aa  249  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  47.5 
 
 
290 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  48.18 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.03 
 
 
284 aa  235  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  44.4 
 
 
290 aa  235  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  43.79 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  43.79 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  42.55 
 
 
280 aa  230  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  40.57 
 
 
301 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  43.43 
 
 
299 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  38.64 
 
 
302 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  43.19 
 
 
273 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  41.52 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  41.76 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  40.71 
 
 
291 aa  198  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  37.45 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 
275 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  38.43 
 
 
291 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  38.27 
 
 
294 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  39.7 
 
 
276 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  41.09 
 
 
278 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.11 
 
 
275 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  38.18 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 
261 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0985  dimethyladenosine transferase  36.14 
 
 
316 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  34.01 
 
 
296 aa  179  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  36.1 
 
 
275 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  38.02 
 
 
296 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000552021  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  37.28 
 
 
260 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 
281 aa  175  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  36.93 
 
 
260 aa  175  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  38.17 
 
 
271 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3348  dimethyladenosine transferase  37.91 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.908407  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0405  dimethyladenosine transferase  37.37 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  37.23 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5229  dimethyladenosine transferase  34.03 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0245049  hitchhiker  0.00538295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  37.46 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07480  dimethyladenosine transferase  35.49 
 
 
296 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.962879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  36.02 
 
 
267 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  36.4 
 
 
276 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  35.31 
 
 
281 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 
276 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  34.83 
 
 
274 aa  169  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11029  dimethyladenosine transferase  36.05 
 
 
317 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  34.41 
 
 
278 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  34.97 
 
 
297 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 
278 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  34.39 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0961  dimethyladenosine transferase  36.19 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  34.87 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3166  dimethyladenosine transferase  36.79 
 
 
288 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1452  dimethyladenosine transferase  35.89 
 
 
307 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  36.7 
 
 
267 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 
297 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1456  dimethyladenosine transferase  36.06 
 
 
287 aa  165  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  34.34 
 
 
297 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  34.77 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  34.83 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  34.46 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3826  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3743  dimethyladenosine transferase  35.38 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  35.46 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1933  dimethyladenosine transferase  35.64 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164143  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  36.04 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  36.43 
 
 
280 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl005  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
267 aa  162  6e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2861  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 
271 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00548999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  34.13 
 
 
302 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  35.58 
 
 
268 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  35.99 
 
 
311 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>