286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0125 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  72.2 
 
 
241 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  72.2 
 
 
241 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  45.04 
 
 
246 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  43.8 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  45.04 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  43.39 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  43.39 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  43.39 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  43.39 
 
 
246 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  43.39 
 
 
246 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  43.39 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  43.39 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  43.39 
 
 
246 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  42.98 
 
 
246 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  42.26 
 
 
260 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  43.8 
 
 
249 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  39.09 
 
 
254 aa  198  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  38.33 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  40.42 
 
 
256 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  40.83 
 
 
249 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  40.17 
 
 
251 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  38.27 
 
 
254 aa  188  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  39.58 
 
 
248 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  37.14 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  38.4 
 
 
249 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  37.13 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  33.88 
 
 
338 aa  154  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  35.91 
 
 
240 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  33.47 
 
 
251 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  34.29 
 
 
251 aa  149  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  35.81 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  33.01 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  31.22 
 
 
241 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  31.95 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  31.72 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  34.12 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
248 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.34 
 
 
258 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  31.49 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  29.54 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  29.88 
 
 
255 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  30.88 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  31.06 
 
 
245 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  32.87 
 
 
249 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  27.39 
 
 
330 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  31.65 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  29.49 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  26.89 
 
 
263 aa  109  3e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  26.41 
 
 
262 aa  102  5e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  27.65 
 
 
237 aa  101  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  27.47 
 
 
268 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  29.49 
 
 
268 aa  92  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  30.37 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  26.32 
 
 
252 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  26.52 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  26.79 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  22.67 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  23.35 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  25.76 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  26.75 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  25.33 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  25.89 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  24.02 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  25.89 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  24.36 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  24.54 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  24.11 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  24.02 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  29.2 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  27.35 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  28.57 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  27.5 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  27.54 
 
 
259 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.66 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  23.25 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  24.66 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  32.59 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  23.14 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  23.53 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  24.43 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  23.86 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  25.7 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  25.45 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  28 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  24.18 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  26.07 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  35.65 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  24.76 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  26.88 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  24.32 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  21.43 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  24.89 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  28.87 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  26.06 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  28.87 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  27.97 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  24.4 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  28.87 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>