More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0120 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  100 
 
 		 203 aa  411  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  71.92 
 
 		 205 aa  313  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  71.92 
 
 		 205 aa  313  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  54.59 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  53.5 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  48.77 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  49.25 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  47.55 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  52.04 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  49.51 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  45.77 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.22 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.04 
 
 		 225 aa  168  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.35 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  42.31 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  40.09 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  38.43 
 
 		 236 aa  161  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  39.81 
 
 		 226 aa  160  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  39.81 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  38.94 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  42.62 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  38.76 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  40 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 688 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  39.6 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  34.4 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  39.89 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.39 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  40.53 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  40.11 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.82 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  38.34 
 
 		 215 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  37.98 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  39.71 
 
 		 236 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  37 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  38.24 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  36.82 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  38.34 
 
 		 901 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  38.5 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  39.23 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  38.86 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  43.01 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.62 
 
 		 210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  42.78 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.25 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38 
 
 		 707 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40.44 
 
 		 671 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  35.47 
 
 		 705 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.74 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  41.24 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  35.96 
 
 		 703 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  39.7 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  40 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  38.17 
 
 		 211 aa  141  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 686 aa  140  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  39.11 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.95 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0512  thymidylate kinase  42.16 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0229  thymidylate kinase  41.24 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0139482  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  36.84 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  34.83 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 686 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  37.13 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  34.33 
 
 		 281 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  37.5 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  40.88 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  36.71 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  37.38 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  37.2 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  37.07 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  36.5 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>