More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0109 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 487 aa  1021    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  81.11 
 
 		 487 aa  851    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  81.11 
 
 		 487 aa  851    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  52.05 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  50.92 
 
 		 494 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.34 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.93 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  48.25 
 
 		 491 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  48.26 
 
 		 491 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.42 
 
 		 494 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  46.41 
 
 		 491 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.63 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.53 
 
 		 495 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.73 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  45.53 
 
 		 495 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  46 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.22 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.22 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  46.39 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  45.71 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.22 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828565 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  45.25 
 
 		 580 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  45.59 
 
 		 2126 aa  424  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  45.49 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  44.76 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  46 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  44.9 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.74 
 
 		 493 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  45.49 
 
 		 2135 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  44.29 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.38 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  44.08 
 
 		 481 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.4 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.92 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.62 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.27 
 
 		 487 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.8 
 
 		 484 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  42.63 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  41.87 
 
 		 2126 aa  392  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  42.57 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  43.48 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  41.95 
 
 		 492 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  43.98 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.39 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.47 
 
 		 488 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  43.29 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  42.74 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.61 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  42.48 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  42.15 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  41.88 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  42.89 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  41.83 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  43.29 
 
 		 487 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  43.09 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  43.47 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.87 
 
 		 492 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  42.03 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.71 
 
 		 492 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.05 
 
 		 489 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  42.48 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.34 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  41.35 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  42.06 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  42.51 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.04 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  41.99 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  41.8 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  41.54 
 
 		 500 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  42 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  43.18 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  41.7 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  40.08 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  42.69 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.02 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  41.6 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  43.65 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  42.77 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  40.25 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  43.24 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.98 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  43.65 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  43.09 
 
 		 487 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  40.66 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  43.09 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  43.6 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  43.29 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  40.66 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  43.29 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.06 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  43.29 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.02 
 
 		 482 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.36 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  40.63 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  41.46 
 
 		 484 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.28 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.05 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  42.37 
 
 		 505 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.05 
 
 		 502 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  40.72 
 
 		 491 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>